RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 OCIAD1Q9NX40 245 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 OR2M5A3KFT3 312 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 BCL2L11O43521 198 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 ADRB1P08588 477 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 CT45A10P0DMU9 189 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 CD226Q15762 336 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 TIGITQ495A1 244 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 OR2T2Q6IF00 324 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 PRSS42Q7Z5A4 293 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 VASH2Q86V25 355 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 OR52N4Q8NGI2 321 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 OR2I1PQ8NGU4 316 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 GREB1Q4ZG55 1949 aa10.78□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 CBR1P16152 277 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 ZBTB25P24278 435 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 AVPR2P30518 371 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 IRF3Q14653 427 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 ISXQ2M1V0 245 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM123Q8N131 208 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 OR8U1Q8NH10 309 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 M1APQ8TC57 530 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 MITD1Q8WV92 249 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa10.77□□□□□ -0.68
PTPRS-201ENST00000262963 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 RFPL4AA6NLU0 287 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 AQP7O14520 342 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 ST8SIA5O15466 376 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 AKR7A2O43488 359 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 OR5G3P0C626 314 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 FCARP24071 287 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 P2RX3P56373 397 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 DEFB124Q8NES8 71 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 GINS3Q9BRX5 216 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 SOX7Q9BT81 388 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 CTAG2O75638 210 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 C20orf24Q9BUV8 137 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 GPR87Q9BY21 358 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 R4GN57 208 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 AQP8O94778 261 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 HPP00738 406 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 SULT1A3P0DMM9 295 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 SULT1A4P0DMN0 295 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 SDHBP21912 280 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFA6P56556 154 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 UBE2G2P60604 165 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 C1QL3Q5VWW1 255 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF787Q6DD87 383 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 OR5AP2Q8NGF4 316 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 SLC39A7Q92504 469 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 ERGIC1Q969X5 290 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 TPPP3Q9BW30 176 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 ICAM5Q9UMF0 924 aa10.77□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 PDCD6O75340 191 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 NGFP01138 241 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 CYC1P08574 325 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 SLC37A1P57057 533 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 GNB1P62873 340 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 C11orf87Q6NUJ2 197 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 FBXO17Q96EF6 278 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 TMED3Q9Y3Q3 217 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 SPRY3O43610 288 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 CLDN23Q96B33 292 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 GPR37O15354 613 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 OR7C2O60412 319 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 OR2C1O95371 312 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 WNT1P04628 370 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 IGHV4-34P06331 123 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 CD96P40200 585 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 PRDX4Q13162 271 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 MICBQ29980 383 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 HES3Q5TGS1 186 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 C17orf107Q6ZR85 190 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 ABCA7Q8IZY2 2146 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 OR2Z1Q8NG97 314 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 OR4F5Q8NH21 305 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 OR4F4Q96R69 305 aa10.76□□□□□ -0.69
PTPRS-201ENST00000262963 PRRX2Q99811 253 aa10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.3 ms