RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 SPDEFO95238 335 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SLC6A1P30531 599 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 IL13RA1P78552 427 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MED29Q9NX70 200 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPN3-201ENST00000262539 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPN3-201ENST00000262539 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF785A8K8V0 405 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 HPGDSO60760 199 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PRF1P14222 555 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPN3-201ENST00000262539 ELK1P19419 428 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPN3-201ENST00000262539 PPT1P50897 306 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 P2RY6Q15077 328 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TATDN3Q17R31 274 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 VASH2Q86V25 355 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 LALBAP00709 142 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SERPINF1P36955 418 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PCM1Q15154 2024 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TXNL1O43396 289 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MELTFP08582 738 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 FUT6P51993 359 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PXT1Q8NFP0 134 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 GPR173Q9NS66 373 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 V9GYH0 126 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 C1QBP02746 253 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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PTPN3-201ENST00000262539 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 RAB3CQ96E17 227 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPN3-201ENST00000262539 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 GZMKP49863 264 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 STPG1Q5TH74 334 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPN3-201ENST00000262539 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 FZR1Q9UM11 496 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 GPR37O15354 613 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 NDUFB3O43676 98 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SP1P08047 785 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 RAB5BP61020 215 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 MDGA2Q7Z553 956 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 MOB3AQ96BX8 217 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPN3-201ENST00000262539 CHST5Q9GZS9 411 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 A6NIN4 97 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ACSM4P0C7M7 580 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SOSTQ9BQB4 213 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 PATE3B3GLJ2 98 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 F8W036 122 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 OR2J3O76001 311 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 UBE2G1P62253 170 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 BLOC1S1P78537 153 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.26□□□□□ -1.25
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