RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 GDNFP39905 211 aa14.94□□□□□ -0.02
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SRSF1-201ENST00000258962 PRDX4Q13162 271 aa14.94□□□□□ -0.02
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SRSF1-201ENST00000258962 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
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SRSF1-201ENST00000258962 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.9□□□□□ -0.02
SRSF1-201ENST00000258962 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa14.9□□□□□ -0.02
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