RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 BPNT1O95861 308 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 PATE4P0C8F1 98 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 PTAFRP25105 342 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 AP3S2P59780 193 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 BTG1P62324 171 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 QRFPP83859 136 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 HGFACQ04756 655 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 BOD1Q96IK1 185 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 IGHV4-39P01824 125 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 PTHLHP12272 177 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 HTR5AP47898 357 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 TNK1Q13470 666 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 SLC22A25Q6T423 547 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 UTS2BQ765I0 119 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 COPZ2Q9P299 210 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 KLK11Q9UBX7 282 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 HMX3A6NHT5 357 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 H7C417 338 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 HEXAP06865 529 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 GSTT2BP0CG30 244 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 HLA-DMAP28067 261 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 TGFBR3Q03167 851 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 TATDN3Q17R31 274 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 PP6455Q8WZ26 134 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 PHF21AQ96BD5 680 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 SGK3Q96BR1 496 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 RADILQ96JH8 1075 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 RAB22AQ9UL26 194 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 CHST5Q9GZS9 411 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 MT-ND4P03905 459 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 UNC119Q13432 240 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 OR10K2Q6IF99 312 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ALG5Q9Y673 324 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 A0A096LPE4 126 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1W2PPZ6 126 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 SULT1C2O00338 296 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 TCRBP04435 133 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 VSIG8P0DPA2 414 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 GIFP27352 417 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 RAB12Q6IQ22 244 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 RNF144BQ7Z419 303 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 RBBP9O75884 186 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 CCNKO75909 580 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 LCATP04180 440 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 HCKP08631 526 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 COX5BP10606 129 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 FAHP16930 419 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 PRSS3P35030 304 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 RAG2P55895 527 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 GPX8Q8TED1 209 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 REEP6Q96HR9 211 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 RGCCQ9H4X1 137 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms