RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ADAM11O75078 769 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 HMGA2P52926 109 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 RHOBP62745 196 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TEX29Q8N6K0 151 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MCHR2Q969V1 340 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 C4orf45Q96LM5 186 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MS4A18H0YCH9 400 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 DNPH1O43598 174 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SFTA3P0C7M3 94 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CD80P33681 288 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TRILQ7L0X0 811 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OCEL1Q9H607 264 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 M0R143 59 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SPRY3O43610 288 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 GOSR1O95249 250 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 GPANK1O95872 356 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CEACAM6P40199 344 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MPLP40238 635 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PTGFRP43088 359 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 P2RY1P47900 373 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 AMTP48728 403 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 LINC00303Q3SY05 128 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 WDR38Q5JTN6 314 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OR8B2Q96RD0 313 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 RHOFQ9HBH0 211 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PDCD6O75340 191 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 HNF1AP20823 631 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OPRM1P35372 400 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SPCS3P61009 180 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 HIST1H3AP68431 136 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 IL24Q13007 206 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 KISS1Q15726 138 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 Q1RN00 199 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ISXQ2M1V0 245 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 LILRA6Q6PI73 481 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ZNF429Q86V71 674 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.44□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SLC31A2O15432 143 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CCKARP32238 428 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 CDAP32320 146 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 DCTDP32321 178 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 STUMQ69YW2 141 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MTURNQ8N3F0 131 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 OR4S2Q8NH73 311 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 DIRC2Q96SL1 478 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 ZNF320A2RRD8 509 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MBTPS2O43462 519 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 INHBBP09529 407 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 LPAR6P43657 344 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 PGFP49763 221 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 WNT3P56703 355 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 DUSP2Q05923 314 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 FOXC1Q12948 553 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 TEX261Q6UWH6 196 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 LYPD8Q6UX82 237 aa6.43□□□□□ -1.38
CPS1-201ENST00000233072 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms