RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 NLRC3Q7RTR2 1065 aa20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF611Q8N823 705 aa20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 OR5H2Q8NGV7 314 aa20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2T35Q8NGX2 323 aa20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 WBP1Q96G27 269 aa20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 MGAT4AQ9UM21 535 aa20.65■□□□□ 0.9
RPUSD1-201ENST00000007264 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa20.64■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CD300LBA8K4G0 201 aa20.64■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP6V1G1O75348 118 aa20.64■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 IGKV1D-12P01611 117 aa20.64■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CEACAM21Q3KPI0 293 aa20.64■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 VWA1Q6PCB0 445 aa20.64■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 HOGA1Q86XE5 327 aa20.64■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 HSPB11Q9Y547 144 aa20.64■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1W2PR80 420 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 RGS13O14921 159 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 PDGFAP04085 211 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 DNASE1P24855 282 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 OR3A3P47888 321 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 GABRA6Q16445 453 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 VAX1Q5SQQ9 334 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC25A26Q70HW3 274 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CALHM1Q8IU99 346 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC22Q8N966 263 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 BHLHE23Q8NDY6 225 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CYYR1Q96J86 154 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF75AQ96N20 296 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CA10Q9NS85 328 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 PQLC2LA1A4F0 135 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 SNU13P55769 128 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 TAS2R46P59540 309 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 TSPAN5P62079 268 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXL14Q8N1E6 418 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ARRDC1Q8N5I2 433 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CDH20Q9HBT6 801 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 HSF4Q9ULV5 492 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 VSIG4Q9Y279 399 aa20.63■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CRYABP02511 175 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 GIPP09681 153 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 GPM6AP51674 278 aa20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 SLA2Q9H6Q3 261 aa20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ST3GAL6Q9Y274 331 aa20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 AKR7A2O43488 359 aa20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 TPOP07202 933 aa20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 SFTPBP07988 381 aa20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 PIGYQ3MUY2 71 aa20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM17Q86X19 198 aa20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2AK2Q8NG84 335 aa20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 HAAOP46952 286 aa20.61■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 FOXF2Q12947 444 aa20.61■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 C11orf88Q6PI97 169 aa20.61■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 C17orf107Q6ZR85 190 aa20.61■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 HPSE2Q8WWQ2 592 aa20.61■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CRIM1Q9NZV1 1036 aa20.61■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2AT4A6NND4 320 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF732B4DXR9 585 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 J3QW42 95 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CELA3BP08861 270 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 IL32P24001 234 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 RAP2BP61225 183 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 CHRFAM7AQ494W8 412 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 SIGIRRQ6IA17 410 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 C9orf62Q8N4C0 152 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 OR5A2Q8NGI9 324 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 TERB2Q8NHR7 220 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 FAAP24Q9BTP7 215 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 FIGNL2A6NMB9 653 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 GOSR2O14653 212 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 TSC22D1Q15714 1073 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 Q5BKY6 102 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 SPATA46Q5T0L3 261 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 MAFIPQ8WZ33 124 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 MRGPRFQ96AM1 343 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 DKK4Q9UBT3 224 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD1-201ENST00000007264 PROCRQ9UNN8 238 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms