RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623706.3

ATRX-212, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 2

Gene ATRX, Length 7,245 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-212ENST00000623706 VPS29Q9UBQ0 182 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 A0A1W2PRS3 328 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 MLNRO43193 412 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 PTGDSP41222 190 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TSPAN7P41732 249 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 SPANXN5Q5MJ07 72 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 LRP10Q7Z4F1 713 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TMEM178AQ8NBL3 297 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 STRADBQ9C0K7 418 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TAS2R5Q9NYW4 299 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 DSCR3O14972 297 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 B4GALT5O43286 388 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 ABHD2P08910 425 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 FURINP09958 794 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 IAPPP10997 89 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 NPPBP16860 134 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 IL3RAP26951 378 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 P2RY4P51582 365 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 SPP2Q13103 211 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 IL13RA2Q14627 380 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 C10orf128Q5T292 105 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 ABHD17BQ5VST6 288 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 MARC1Q5VT66 337 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 CDCP2Q5VXM1 449 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 CGB2Q6NT52 195 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 DRAM2Q6UX65 266 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 DLEU7Q6UYE1 221 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 BTLAQ7Z6A9 289 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 FAM174AQ8TBP5 190 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 STAG3L4Q8TBR4 150 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 RANBP9Q96S59 729 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 SLC30A3Q99726 388 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 WDR54Q9H977 334 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 AKIP1Q9NQ31 210 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 IL37Q9NZH6 218 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 NRCAMQ92823 1304 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 RS1O15537 224 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 DOK2O60496 412 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 VIPP01282 170 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 IGHG3P01860 377 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TACR2P21452 398 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 FDXRP22570 491 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 CA6P23280 308 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 NMBRP28336 390 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 GNG4P50150 75 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 FCRLAQ7L513 359 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 SHFQ7M4L6 423 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 SLC39A7Q92504 469 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TMBIM1Q969X1 311 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 PIK3IP1Q96FE7 263 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 C2orf40Q9H1Z8 148 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 SH2D2AQ9NP31 389 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 ZNF446Q9NWS9 450 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 MARCH11A6NNE9 402 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 B4DXG7 233 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 APOC2P02655 101 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 APCSP02743 223 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 ACYP1P07311 99 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 EFNA3P52797 238 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 CLDN12P56749 244 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 HBA1P69905 142 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 IRF9Q00978 393 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 PARP15Q460N3 678 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 CD300LDQ6UXZ3 194 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 C6orf120Q7Z4R8 191 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 TMEM25Q86YD3 366 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 MDS2Q8NDY4 140 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 OR52I1Q8NGK6 324 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 ABHD17AQ96GS6 310 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 C18orf15Q96N68 181 aa3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
ATRX-212ENST00000623706 GNG12Q9UBI6 72 aa3.11□□□□□ -1.91
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