RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 SCAND1P57086 179 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRTM1Q86UE6 522 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 TCTE3Q8IZS6 198 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 BMP5P22003 454 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 TOR2AQ5JU69 321 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 C6orf201Q7Z4U5 140 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 OR8B12Q8NGG6 310 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10X1Q8NGY0 326 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 EDARADDQ8WWZ3 215 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 CHST6Q9GZX3 395 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 RTTNQ86VV8 2226 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 CD96P40200 585 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF83P51522 516 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 IRF3Q14653 427 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 GDF15Q99988 308 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 NME2P1O60361 137 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 SELENOPP49908 381 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PRDX4Q13162 271 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 SP6Q3SY56 376 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM122BQ7Z309 247 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 GALMQ96C23 342 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 FAAP24Q9BTP7 215 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 H3F3CQ6NXT2 135 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 OR2Z1Q8NG97 314 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 SSX4O60224 188 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ALX3O95076 343 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 IAPPP10997 89 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PLA1AQ53H76 456 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC25A45Q8N413 288 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 OR8U1Q8NH10 309 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 OR4C45A6NMZ5 311 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 BGLAPP02818 100 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 OR13C7P0DN81 318 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXO17Q96EF6 278 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 UCN2Q96RP3 112 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR54Q9H977 334 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNIP4Q6PIL6 250 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10AC1Q8NH08 325 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ARID2Q68CP9 1835 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMB3P49720 205 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 SOX8P57073 446 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 C21orf140B9A014 251 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 LFNGQ8NES3 379 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PLPPR2Q96GM1 343 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PRSS27Q9BQR3 290 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNK15Q9H427 330 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 GP1BAP07359 652 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 HLA-DOBP13765 273 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGEA5P43359 124 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 OR2M3Q8NG83 312 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 AK3Q9UIJ7 227 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 C4orf51C9J302 202 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 CD80P33681 288 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 LSM6P62312 80 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD34BA5PLL1 514 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 FUT5Q11128 374 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ST3GAL2Q16842 350 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 Q8IYB0 196 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10P1Q8NGE3 313 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 C19orf12Q9NSK7 152 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF724A8MTY0 619 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR31O00270 319 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 C3AR1Q16581 482 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 Q6ZRG5 221 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 DHODHQ02127 395 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM74A1Q5RGS3 127 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 MRGPREQ86SM8 312 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 BTBD17A6NE02 478 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCD4O14678 606 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PTP4A3O75365 173 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PNLIPP16233 465 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 DHRS2Q13268 280 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 THNSL2Q86YJ6 484 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM58AQ8N1B3 248 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ZDHHC22Q8N966 263 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 FZR1Q9UM11 496 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 H3BP45 60 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 CDC14BO60729 498 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 CT45A6P0DMU7 189 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 CT45A5P0DMU8 189 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 CT45A7P0DMV0 189 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 CT45A1Q5HYN5 189 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 CT45A3Q8NHU0 189 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCA7Q8IZY2 2146 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRJ-208ENST00000615445 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 FPR2P25090 351 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 LCN15Q6UWW0 184 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 TUSC5Q8IXB3 177 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 WFDC6Q9BQY6 131 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 MARVELD1Q9BSK0 173 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 GABRA4P48169 554 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 THBS3P49746 956 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRJ-208ENST00000615445 RAG2P55895 527 aa18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms