RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 GPNMBQ14956 572 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 C11orf87Q6NUJ2 197 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 BCORP1Q8N888 145 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 LYRM4Q9HD34 91 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 PRDM7Q9NQW5 492 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FIGNL2A6NMB9 653 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FUCA1P04066 466 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM24BQ8N5W8 94 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 RPEQ96AT9 228 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 CBR3O75828 277 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ADAM20O43506 726 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 EMP1P54849 157 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 IGFBP7Q16270 282 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 Q6ZNX1 250 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 NKAIN4Q8IVV8 208 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC35B3Q9H1N7 401 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM78BQ5VT40 261 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 OR6S1Q8NH40 331 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM9BQ9NQ34 198 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 DRGXA6NNA5 263 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 LY86O95711 162 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 C19orf57Q0VDD7 668 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF683Q8IZ20 524 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 UQCC1Q9NVA1 299 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 IL36GQ9NZH8 169 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 PAM16Q9Y3D7 125 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCA1O95477 2261 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 F11P03951 625 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXL6Q8N531 539 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PN81 502 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 BTLAQ7Z6A9 289 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM99Q8N816 258 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 THYN1Q9P016 225 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 LGALS7P47929 136 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SP6Q3SY56 376 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TAS1R1Q7RTX1 841 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TBX15Q96SF7 602 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 MASP2O00187 686 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 LYG1Q8N1E2 194 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SH2D2AQ9NP31 389 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 DEFB108AA8MXU0 73 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 PTGESO14684 152 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 B3GALT4O96024 378 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 DCTDP32321 178 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 VRK3Q8IV63 474 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 ARL17AQ8IVW1 177 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TAPBPO15533 448 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM128Q5BJH2 165 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 SCD5Q86SK9 330 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 OXGR1Q96P68 337 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 MMP24Q9Y5R2 645 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM129A0AVI4 362 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 IFITM5A6NNB3 132 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CD226Q15762 336 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB29O14966 203 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CD96P40200 585 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP1CAP62136 330 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM251Q8N6I4 163 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 OR1L6Q8NGR2 347 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC45A2Q9UMX9 530 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 K7ESF4 209 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 ICOSLGO75144 302 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 FUT6P51993 359 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 IGSF11Q5DX21 431 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4A47Q6IF82 309 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 GFRALQ6UXV0 394 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SMIM14Q96QK8 99 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PRSS37A4D1T9 235 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 MBTPS2O43462 519 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PLAURQ03405 335 aa16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms