RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	AWAT1	Q58HT5	328 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR13H1	Q8NG92	308 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SMIM8	Q96KF7	97 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PPP5D1	E7EU14	171 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ALOX12B	O75342	701 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR13C7	P0DN81	318 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	VSIG8	P0DPA2	414 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CTLA4	P16410	223 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TCN2	P20062	427 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TUBG1	P23258	451 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM33	P57088	247 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RELB	Q01201	579 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MGAT2	Q10469	447 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	IL24	Q13007	206 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SHB	Q15464	509 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	AARD	Q4LEZ3	155 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RAET1L	Q5VY80	246 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR52W1	Q6IF63	320 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR6X1	Q8NH79	312 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GPR119	Q8TDV5	335 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM18	Q96B42	140 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RAB40C	Q96S21	281 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	BANF2	Q9H503	90 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TINAG	Q9UJW2	476 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DEDD	O75618	318 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NTN1	O95631	604 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		P04436	131 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	IL9	P15248	144 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NQO2	P16083	231 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FCAR	P24071	287 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ID4	P47928	161 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SULT1A1	P50225	295 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FUT6	P51993	359 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CLDN17	P56750	224 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	CATR1	Q13166	79 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	KISS1	Q15726	138 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	HFE	Q30201	348 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	IGSF11	Q5DX21	431 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF429	Q86V71	674 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	NUBPL	Q8TB37	319 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF519	Q8TB69	540 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	BAD	Q92934	168 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM100	Q9NV29	134 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	KIAA1456	Q9P272	454 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		V9GYS6	101 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MUC3A	Q02505	3323 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TTC28	Q96AY4	2481 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	VCAN	P13611	3396 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	FAM221A	A4D161	298 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	C4orf51	C9J302	202 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790		M0R135	149 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	QDPR	P09417	244 aa		3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
VMP1-216	ENST00000592790	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91

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