RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	TGM4	P49221	684 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	GPM6A	P51674	278 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	CXCR4	P61073	352 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	EFNB1	P98172	346 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	IKZF1	Q13422	519 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	CEP78	Q5JTW2	689 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	STUM	Q69YW2	141 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM163	Q8TC26	289 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	LHX4	Q969G2	390 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	MED30	Q96HR3	178 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	GPR84	Q9NQS5	396 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578		A0A1B0GW55	424 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF732	B4DXR9	585 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	IGLV3-1	P01715	115 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	AMY2B	P19961	511 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	GLRA1	P23415	457 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	EPHA2	P29317	976 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578		Q6ZTK2	550 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	GID4	Q8IVV7	300 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	OR51I2	Q9H344	312 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	NLK	Q9UBE8	527 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DUX4	Q9UBX2	424 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	BTBD17	A6NE02	478 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	OR2AT4	A6NND4	320 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	PRR32	B1ATL7	298 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578		M0R129	80 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	GPR137B	O60478	399 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DHRS3	O75911	302 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	TTR	P02766	147 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	EGR3	Q06889	387 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	MOB3C	Q70IA8	216 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	FGFRL1	Q8N441	504 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	SGCD	Q92629	289 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	APOL4	Q9BPW4	351 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	CLN6	Q9NWW5	311 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578		R4GMQ9	66 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	PLXNB1	O43157	2135 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	SIGLEC5	O15389	551 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	XPNPEP2	O43895	674 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PSME3-215	ENST00000592578	RHBDL1	O75783	438 aa		11.71	□□□□□ -0.53

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