RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TCRBV5S2A0A599 114 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF732B4DXR9 585 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPZA1P52907 286 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 GNG3P63215 75 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf42Q8N5U0 333 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX47Q8TBZ9 253 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 MRAPQ8TCY5 172 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R14AQ96A00 147 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-211ENST00000590874 REEP1Q9H902 201 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF702PQ9H963 129 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TAGLN3Q9UI15 199 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-211ENST00000590874 ERVFRD-1P60508 538 aa20.78■□□□□ 0.92
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CAPNS1-211ENST00000590874 KRT74Q7RTS7 529 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 THAP5Q7Z6K1 395 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.78■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T29Q8NH02 315 aa20.78■□□□□ 0.92
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CAPNS1-211ENST00000590874 AQP3Q92482 292 aa20.78■□□□□ 0.92
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CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf89Q6UX73 402 aa20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 CD300LDQ6UXZ3 194 aa20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 CD177Q8N6Q3 437 aa20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP28Q9H239 520 aa20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGIXQ9H6Y5 334 aa20.77■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa20.77■□□□□ 0.92
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CAPNS1-211ENST00000590874 CD28P10747 220 aa20.76■□□□□ 0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL3L1P16619 93 aa20.76■□□□□ 0.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM200BQ69YZ2 307 aa20.76■□□□□ 0.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF488Q96MN9 340 aa20.76■□□□□ 0.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR5B21A6NL26 309 aa20.74■□□□□ 0.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 RASL12Q9NYN1 266 aa20.74■□□□□ 0.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 LGALS4P56470 323 aa20.73■□□□□ 0.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT77Q7Z794 578 aa20.73■□□□□ 0.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 TCF19Q9Y242 345 aa20.73■□□□□ 0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0U1RQV5 110 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPH5 198 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 VGLL3A8MV65 326 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD9O00233 223 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 ALOX5APP20292 161 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 HCCSP53701 268 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM21Q3B7S5 101 aa20.72■□□□□ 0.91
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