RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 MIOXQ9UGB7 285 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 MBPP02686 304 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OPN1MWP04001 364 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OR8U8P0C7N1 319 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 FABP4P15090 132 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 IGSF11Q5DX21 431 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 C10orf35Q96D05 121 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 WFDC6Q9BQY6 131 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 RTL8AQ9BWD3 113 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CRLF2Q9HC73 371 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PPH5 198 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PPQ1 181 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 FAM221AA4D161 298 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CST7O76096 145 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 EFNB2P52799 333 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 HLA-DRB3P79483 266 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 TCTN1Q2MV58 587 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 SP6Q3SY56 376 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CARFQ8N187 725 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 GPR119Q8TDV5 335 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 SOSTQ9BQB4 213 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OR51B6Q9H340 312 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 LHX9Q9NQ69 397 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OSGIN2Q9Y236 505 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ABCD4O14678 606 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CXCL12P48061 93 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 SULT1A1P50225 295 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 MYBPHQ13203 477 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM240Q5SV17 173 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 KCNE4Q8WWG9 221 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CORO2AQ92828 525 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 KCNK15Q9H427 330 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 GREM1O60565 184 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 LY86O95711 162 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 GFERP55789 205 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 SLC37A1P57057 533 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 C9orf135Q5VTT2 229 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 SYT13Q7L8C5 426 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ZAR1Q86SH2 424 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 VSIG4Q9Y279 399 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OR3A4PP47883 348 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 SKP2Q13309 424 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 RAB35Q15286 201 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 NUBPLQ8TB37 319 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 NPTNQ9Y639 398 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CKAP5Q14008 2032 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 G3V3Q6 166 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 WDR1O75083 606 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 SULT1A2P50226 295 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF90Q03938 601 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 IL24Q13007 206 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CD226Q15762 336 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OR2A2Q6IF42 318 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 PARP14Q460N5 1801 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PPC1 479 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 OR2W5A6NFC9 320 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 FAM74A7A6NL05 159 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 A8MXK9 166 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 PDCD6O75340 191 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CTGFP29279 349 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CD200P41217 278 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 S100A7AQ86SG5 101 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ASB10Q8WXI3 467 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 EXTL1Q92935 676 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 KLF4O43474 513 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 VSIG8P0DPA2 414 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 CDAP32320 146 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ARR3P36575 388 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 FAM3AP98173 230 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 MICBQ29980 383 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms