RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM169BQ8N8A8 192 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 MCUBQ9NWR8 336 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL36GQ9NZH8 169 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF835Q9Y2P0 537 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 MPC1Q9Y5U8 109 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARL6IP1Q15041 203 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM255AQ5JRV8 349 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 FJX1Q86VR8 437 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR51B6Q9H340 312 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALG5Q9Y673 324 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 HMX3A6NHT5 357 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL32P24001 234 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 RCVRNP35243 200 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 OPRM1P35372 400 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM50BP56557 158 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP1CBP62140 327 aa25.05■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP295Q9C0D2 2601 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAV6A0A075B6T7 132 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 PQLC2LA1A4F0 135 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 AGFG2O95081 481 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 HTR3BO95264 441 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYB5AP00167 134 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 H2AFB2P0C5Z0 115 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 STEAP1BQ6NZ63 245 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5A2Q8NGI9 324 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4C16Q8NGL9 310 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR56B4Q8NH76 319 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASF1BQ9NVP2 202 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ETAA1Q9NY74 926 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 MSTNO14793 375 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANGPTL7O43827 346 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGLV1-44P01699 117 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 UCP2P55851 309 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNG2P59768 71 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBPJQ06330 500 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLAC9Q5JTB6 97 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIGMQ9H3S5 423 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 TUBG1P23258 451 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q96M66 194 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 TUBG2Q9NRH3 451 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 MGAQ8IWI9 3026 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 MFNGO00587 321 aa25.02■■□□□ 1.6
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CD3DP04234 171 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 HPSE2Q8WWQ2 592 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 C20orf85Q9H1P6 137 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A15Q9Y619 301 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF35P13682 527 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAC2P15153 192 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TIMM23BQ5SRD1 257 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2T2Q6IF00 324 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAAP20Q6NZ36 180 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR51F2Q8NH61 342 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRIM1Q9NZV1 1036 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCNKO75909 580 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD74P04233 296 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 SELEP16581 610 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAD52P43351 418 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPATA46Q5T0L3 261 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 SAXO1Q8IYX7 474 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF611Q8N823 705 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1J1Q8NGS3 322 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR8S1Q8NH09 359 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2J1Q9GZK6 312 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFT46Q9NQC8 304 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNK7Q9Y2U2 307 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKR7A2O43488 359 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 CECR9P0C854 216 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD300CQ08708 224 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf174Q8IYL3 243 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 BHLHE23Q8NDY6 225 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A40Q8TBP6 338 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5P3Q8WZ94 311 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 POM121Q96HA1 1249 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa24.99■■□□□ 1.59
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