RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNFT2Q96EX2 444 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF488Q96MN9 340 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 MBOAT4Q96T53 435 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 S100A14Q9HCY8 104 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 GNG8Q9UK08 70 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 V9GYS6 101 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR5B21A6NL26 309 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR2AT4A6NND4 320 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRTN3P24158 256 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 HAAOP46952 286 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 DGUOKQ16854 277 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 KRT74Q7RTS7 529 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 CATSPERDQ86XM0 798 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 AQP3Q92482 292 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 RORBQ92753 470 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 GAFA1Q96PS6 74 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIRPDQ9H106 197 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A1B0GVI7 797 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM89A2RUT3 159 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SYNGR1O43759 233 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 BAG2O95816 211 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 NDUFB7P17568 137 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TGM4P49221 684 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMED1Q13445 227 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC29A1Q99808 456 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADI1Q9BV57 179 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 DLGAP1O14490 977 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SYT7O43581 403 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SULT1C4O75897 302 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSG2P11465 335 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 DLX1P56177 255 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 IL13RA1P78552 427 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM42Q69YG0 159 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 RDH10Q8IZV5 341 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 DAPL1A0PJW8 107 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIGLEC5O15389 551 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 CFPP27918 469 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDCD1Q15116 288 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDONQ4KMG0 1287 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF573Q86YE8 665 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 C3orf56Q8N813 242 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ITFG2Q969R8 447 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC25A28Q96A46 364 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 MED30Q96HR3 178 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 E9PQ18 207 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 J3QT63 122 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 INMTO95050 263 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGHV1-69P01742 117 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCL1P22362 96 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIR3DL2P43630 455 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms