RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559192.5

USP3-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3, Length 5,499 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-210ENST00000559192 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 MRGPREQ86SM8 312 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 KLF15Q9UIH9 416 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.36□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 XKRY2A2RUG3 117 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 AQP7P3A6NL99 342 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 PPICP45877 212 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 HTR5AP47898 357 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 GSK3AP49840 483 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ECH1Q13011 328 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 LILRA6Q6PI73 481 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 RTL10Q7L3V2 364 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 LGI3Q8N145 548 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 GPX8Q8TED1 209 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 TOX2Q96NM4 488 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 FBXL17Q9UF56 701 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 TSC2P49815 1807 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 A0A087WV48 116 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 E5RGE8 158 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 CHEK1O14757 476 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 MPPED1O15442 326 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ST8SIA3O43173 380 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 CST4P01036 141 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 TBPP20226 339 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 GAS1P54826 345 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 SCAND1P57086 179 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 YPEL5P62699 121 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 MFAP5Q13361 173 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 NSG2Q9Y328 171 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 OR2M5A3KFT3 312 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 C9J4A7 227 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 SIAH2O43255 324 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 CLDN1O95832 211 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 DDAH2O95865 285 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 STAG3L2P0CL84 134 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ZNF345Q14585 488 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ZNF141Q15928 474 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 IL22RA2Q969J5 263 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 NMES1Q9C002 83 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 LINC01553A4QN01 128 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 CDC14BO60729 498 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 IL9P15248 144 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 AADACP22760 399 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 OR4F5Q8NH21 305 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 OR4F4Q96R69 305 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 AMELYQ99218 206 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 PRRX2Q99811 253 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 CA14Q9ULX7 337 aa6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 A0A1W2PPE2 198 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 FRG2CA6NGY1 282 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 GJE1A6NN92 205 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 A8MXK9 166 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 GPR37O15354 613 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 OR2J2O76002 312 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 TK1P04183 234 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 SLC25A4P12235 298 aa6.34□□□□□ -1.39
USP3-210ENST00000559192 ECI1P42126 302 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms