RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF91Q05481 1191 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MIDNQ504T8 468 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OLFML2AQ68BL7 652 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GATAD2BQ8WXI9 593 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDFY2Q96P53 400 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTTY10Q9BZA0 68 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHIAQ9BZP6 476 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PBOV1Q9GZY1 135 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM206AQ9NX38 181 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CTSZQ9UBR2 303 aa16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLPSL1A2RUU4 121 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAM20O43506 726 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MMP9P14780 707 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AQP4P55087 323 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL15P61313 204 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACTC1P68032 377 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACTA1P68133 377 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RELBQ01201 579 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF85Q03923 595 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDCD1Q15116 288 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf91Q3C1V1 193 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LAIR2Q6ISS4 152 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YIPF7Q8N8F6 280 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SETD9Q8NE22 299 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBC1D15Q8TC07 691 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSMEM1Q8WWF3 244 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LGALS12Q96DT0 336 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBX15Q96SF7 602 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF649Q9BS31 505 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACOXLQ9NUZ1 547 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1orf123Q9NWV4 160 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNX5Q9Y5X3 404 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 R4GMQ9 66 aa16.06■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM210A6NLX4 147 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C3orf80F5H4A9 247 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CST4P01036 141 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRDX4Q13162 271 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 METTL11BQ5VVY1 283 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCTD8Q6ZWB6 473 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIGCQ92535 297 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBX5Q99593 518 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CITED1Q99966 193 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AMBNQ9NP70 447 aa16.05■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOTCH1P46531 2555 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OOEPA6NGQ2 149 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RRP9O43818 475 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SULT1C4O75897 302 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ECDO95905 644 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV3-1P01715 115 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHV1-69P01742 117 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHA1P01876 353 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB40BQ12829 278 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBTB37Q5TC79 503 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR51E1Q8TCB6 317 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DYRK2Q92630 601 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SIRPDQ9H106 197 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RASSF4Q9H2L5 321 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR84Q9NQS5 396 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR52A1Q9UKL2 312 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYRFQ9Y2G1 1151 aa16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 METTL15A6NJ78 407 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF850A8MQ14 1090 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BRICD5Q6PL45 260 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACBD7Q8N6N7 88 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LYZL4Q96KX0 146 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 JAM3Q9BX67 310 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ENPP5Q9UJA9 477 aa16.03■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 M0QZ24 198 aa16.02■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIMM23O14925 209 aa16.02■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHRS3O75911 302 aa16.02■□□□□ 0.16
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms