RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 RIPPLY3P57055 190 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZMYND11Q15326 602 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PLET1Q6UQ28 207 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TEX261Q6UWH6 196 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 UFD1Q92890 307 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PTP4A1Q93096 173 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF799Q96GE5 643 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 U3KQ87 197 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MT-ND5P03915 603 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MAP2K3P46734 347 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 DAPP51397 102 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ARHGDIAP52565 204 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 KLRD1Q13241 179 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF273Q14593 569 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 GRK1Q15835 563 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TATDN3Q17R31 274 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 APH1BQ8WW43 257 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 NABP1Q96AH0 204 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 IFT46Q9NQC8 304 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 BHLHE40O14503 412 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RRASP10301 218 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZP3P21754 424 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 SDHAP31040 664 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 EDDM3AQ14507 147 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 DTX2Q86UW9 622 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 STX19Q8N4C7 294 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR2T29Q8NH02 315 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TMEM45BQ96B21 275 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TMEM186Q96B77 213 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PGAM5Q96HS1 289 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ALG12Q9BV10 488 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 VENTXO95231 258 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 CSF3P09919 207 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 COX7A1P24310 79 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 SLC6A6P31641 620 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 FHL1Q13642 323 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR8G1Q15617 311 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TIGD4Q8IY51 512 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 TIMD4Q96H15 378 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ATF6BQ99941 703 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 CHST6Q9GZX3 395 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 GPR160Q9UJ42 338 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZNF98A6NK75 572 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PLA2G10O15496 165 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 PTP4A3O75365 173 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 IFNA7P01567 189 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 HLA-DQB1P01920 261 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 H2BFMP0C1H6 154 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 FAHP16930 419 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 GPM6AP51674 278 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 BRICD5Q6PL45 260 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 OR8H3Q8N146 312 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RDH5Q92781 318 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 GGHQ92820 318 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-212ENST00000548567 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms