RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 RAB18Q9NP72 206 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ABCA4P78363 2273 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 A0A1B0GVI7 797 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 AZIN1O14977 448 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PDE6DO43924 150 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 JTBO76095 146 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ACTL6AO96019 429 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 AGTR2P50052 363 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TNFSF10P50591 281 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ZNF134P52741 427 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 MVDP53602 400 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NSDHLQ15738 373 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NRF1Q16656 503 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 C1orf189Q5VU69 101 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TMEM42Q69YG0 159 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TMEM107Q6UX40 140 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 DRAM2Q6UX65 266 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 GFRALQ6UXV0 394 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 DTX2Q86UW9 622 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TMEM163Q8TC26 289 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TOMM40LQ969M1 308 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 PIGTQ969N2 578 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 RCN3Q96D15 328 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 OR52E6Q96RD3 313 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 BEX1Q9HBH7 125 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 WFDC1Q9HC57 220 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 HHLA2Q9UM44 414 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-212ENST00000535535 SCN2AQ99250 2005 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 OR6C6A6NF89 314 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 HCRTR1O43613 425 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 RGS11O94810 467 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 ARG1P05089 322 aa6.77□□□□□ -1.33
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LMO3-212ENST00000535535 PVRP15151 417 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 MMP11P24347 488 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 KDELR1P24390 212 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 LGALS7P47929 136 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 TAS2R41P59536 307 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 CKS1BP61024 79 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 DEFA5Q01523 94 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 Q0VFX4 171 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 MFAP5Q13361 173 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 LAS2Q8IYD9 372 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 M1APQ8TC57 530 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 MALSU1Q96EH3 234 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 ARHGDIGQ99819 225 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 LHPPQ9H008 270 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 EMCNQ9ULC0 261 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 DAPP1Q9UN19 280 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 JMJD1CQ15652 2540 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-212ENST00000535535 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.76□□□□□ -1.33
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