RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531867.1

PUM1-222, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 4

Gene PUM1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-222	ENST00000531867	CCR4	P51679	360 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	RAB11A	P62491	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	CSNK2B	P67870	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	SLC35A1	P78382	337 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	PAX2	Q02962	417 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	GPR50	Q13585	617 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	RAB11B	Q15907	218 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	SYPL1	Q16563	259 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	RAB1C	Q92928	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	RAB8B	Q92930	207 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	PIGU	Q9H490	435 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867		K7EIL1	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	MB	P02144	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	C2	P06681	752 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	BCKDHA	P12694	445 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ACKR3	P25106	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	CD80	P33681	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	P2RY4	P51582	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	OR2B6	P58173	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	CCL8	P80075	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF141	Q15928	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	MDP1	Q86V88	176 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	DYRK2	Q92630	601 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	CDKL2	Q92772	493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	EBPL	Q9BY08	206 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867		A0A1W2PPV4	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	CCS	O14618	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	NBR2	O15453	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF432	O94892	652 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	GSTA1	P08263	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	MELTF	P08582	738 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	UMPS	P11172	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF250	P15622	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	SELENOV	P59797	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	BDH1	Q02338	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	TAF13	Q15543	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUM1-222	ENST00000531867	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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