RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524296.5

SFI1-228, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 5

Gene SFI1, Length 2,108 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-228	ENST00000524296	HOXB5	P09067	269 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CPT2	P23786	658 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	ADH6	P28332	368 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CAV2	P51636	162 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	RHOF	Q9HBH0	211 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	GDF9	O60383	454 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	DHRS3	O75911	302 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	SERPINA2	P20848	420 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	MSR1	P21757	451 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	HOXA6	P31267	233 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	PTGER4	P35408	488 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	NPBWR1	P48145	328 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CLDN17	P56750	224 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	LCN10	Q6JVE6	187 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	FADS6	Q8N9I5	356 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	WNT2B	Q93097	391 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	S100A13	Q99584	98 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	SFTPB	P07988	381 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	HKR1	P10072	659 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	RFC3	P40938	356 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CHST5	Q9GZS9	411 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	PATE3	B3GLJ2	98 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	LRP3	O75074	770 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	HEXA	P06865	529 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	FCGR2A	P12318	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	KLK2	P20151	261 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	C10orf128	Q5T292	105 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296		Q6ZSR3	168 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	HAS2	Q92819	552 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CRB3	Q9BUF7	120 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	NELFA	Q9H3P2	528 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	MED6	O75586	246 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	DKK1	O94907	266 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CST4	P01036	141 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	KNG1	P01042	644 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	ZNF708	P17019	499 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	LPAR6	P43657	344 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CSNK1A1	P48729	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	SULT1A2	P50226	295 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	RAB13	P51153	203 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	UBE2V2	Q15819	145 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	C10orf35	Q96D05	121 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	RASL10B	Q96S79	203 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	RARRES3	Q9UL19	164 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CFI	P05156	583 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	FAH	P16930	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	SPSB2	Q99619	263 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SFI1-228	ENST00000524296	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms