RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515170.5

RAPGEF6-214, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 2

Gene RAPGEF6, Length 4,103 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-214ENST00000515170 PRR33A8MZF0 331 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 H7C2Y5 167 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 XRCC3O43542 346 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 BPNT1O95861 308 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 OR5H8P0DN80 308 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 FCGR2CP31995 323 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 SUCNR1Q9BXA5 334 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 CD300LBA8K4G0 201 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 TTRP02766 147 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 PGA4P0DJD7 388 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 PGA3P0DJD8 388 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 CEACAM1P13688 526 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 MST1P26927 711 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 TAS2R31P59538 309 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 RAB2AP61019 212 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 PSG4Q00888 419 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 FBXW9Q5XUX1 488 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 MDP1Q86V88 176 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 POC1BQ8TC44 478 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 GPR27Q9NS67 375 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 DEPPQ9NTK1 212 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ATRXP46100 2492 aa8.7□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 HSPB2A8KAH6 182 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 B8ZZF3 427 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 CTAG2O75638 210 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 THBS4P35443 961 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 FUT6P51993 359 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 PPP1CBP62140 327 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 HSPB2Q16082 182 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 CCL17Q92583 94 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 CREBBPQ92793 2442 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 SOCS1O15524 211 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ZIC3O60481 467 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 GSK3AP49840 483 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 SSX9Q7RTT3 188 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 MAP6Q96JE9 813 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ZNF488Q96MN9 340 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 CDIPTO14735 213 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 KLF4O43474 513 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 IFNA17P01571 189 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 OR8U9P0C7N5 309 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 SP6Q3SY56 376 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 LILRB2Q8N423 598 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 DYRK2Q92630 601 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 STARD10Q9Y365 291 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 A0A0A6YYJ9 748 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 MPGP29372 298 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ETV6P41212 452 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 COL19A1Q14993 1142 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 SMUG1Q53HV7 270 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 HACD4Q5VWC8 232 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 TFAP2EQ6VUC0 442 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ZNF709Q8N972 641 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 LHFPL6Q9Y693 200 aa8.69□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.68□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.68□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ALX3O95076 343 aa8.68□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 ZNF17P17021 662 aa8.68□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 MMP16P51512 607 aa8.68□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 GNG3P63215 75 aa8.68□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 FGL1Q08830 312 aa8.68□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 FAM122BQ7Z309 247 aa8.68□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.68□□□□□ -1.02
RAPGEF6-214ENST00000515170 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms