RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 H0YGG7 62 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HS3ST1O14792 307 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNFSF15O95150 251 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZGLP1P0C6A0 271 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SDC1P18827 310 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AMER3Q8N944 861 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR2V1Q8NHB1 315 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF519Q8TB69 540 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GALNT14Q96FL9 552 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRDM14Q9GZV8 571 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AGAP20933 346 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TPPP2P59282 170 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CD226Q15762 336 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR52N5Q8NH56 324 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLN8Q9UBY8 286 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NXPH1P58417 271 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IL24Q13007 206 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IQCJQ1A5X6 159 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MOGAT1Q96PD6 335 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CXXC4Q9H2H0 198 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPG11Q96JI7 2443 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LILRA2Q8N149 483 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC74AQ96AQ1 378 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HRASLSQ9HDD0 168 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 K7EPK0 472 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TCTN1Q2MV58 587 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNAI3Q3KNW1 292 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PERM1Q5SV97 790 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CMC1Q7Z7K0 106 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR5A2Q8NGI9 324 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DSPPQ9NZW4 1301 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCSO14618 274 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CTDSPLO15194 276 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COX6B1P14854 86 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BMP5P22003 454 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CSRP2Q16527 193 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NPNTQ6UXI9 565 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 D2HGDHQ8N465 521 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DUSP18Q8NEJ0 188 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR1J1Q8NGS3 322 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LHX3Q9UBR4 397 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RAB29O14966 203 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VDAC1P21796 283 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SULT1A2P50226 295 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IRF3Q14653 427 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BATFQ16520 125 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GFRALQ6UXV0 394 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC30A7Q8NEW0 376 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ST8SIA2Q92186 375 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GGACTQ9BVM4 153 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EGFL7Q9UHF1 273 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NBASA2RRP1 2371 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 F5H5K5 113 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 J3QLI3 93 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADRB1P08588 477 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPL29P47914 159 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR5AR1Q8NGP9 310 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF681Q96N22 645 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MFFQ9GZY8 342 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLDN2P57739 230 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WDFY2Q96P53 400 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF665Q9H7R5 613 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM38BQ9NVV0 291 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CA14Q9ULX7 337 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa4.05□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PSMD9O00233 223 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MPGP29372 298 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GLYATL3Q5SZD4 288 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM57AQ8TBR7 257 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TFAP2BQ92481 460 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EML6Q6ZMW3 1958 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 P2RY10O00398 339 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LAMP1P11279 417 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PAX1P15863 534 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CD1CP29017 333 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF83P51522 516 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CAV2P51636 162 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 B4GALNT1Q00973 533 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SQSTM1Q13501 440 aa4.04□□□□□ -1.76
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR13C9Q8NGT0 318 aa4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms