RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 VSIG4Q9Y279 399 aa4.15□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR2AT4A6NND4 320 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 K7ENP7 123 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SYNGR1O43759 233 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SMPD2O60906 423 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF205O95201 554 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM87AP0C7U9 286 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 INPP1P49441 399 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PCBD1P61457 104 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PRDX4Q13162 271 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MICBQ29980 383 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SPRNQ5BIV9 151 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 STEAP1BQ6NZ63 245 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 Q6ZT83 130 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MOB3CQ70IA8 216 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CD163Q86VB7 1156 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CDH26Q8IXH8 852 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 DIABLOQ9NR28 239 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PIPOXQ9P0Z9 390 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RAXQ9Y2V3 346 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 DHRS7CA6NNS2 312 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RHBDL1O75783 438 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RBBP9O75884 186 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PMP2P02689 132 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TFF1P04155 84 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CSN2P05814 226 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SULT1A3P0DMM9 295 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SULT1A4P0DMN0 295 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 COX5BP10606 129 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 BCL3P20749 454 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CCKARP32238 428 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GPM6AP51674 278 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MTCP1P56278 107 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CLVS2Q5SYC1 327 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CHMP1BQ7LBR1 199 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM229BQ8NBD8 167 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CHST4Q8NCG5 386 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC30A7Q8NEW0 376 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 WNT2BQ93097 391 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MICU1Q9BPX6 476 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SULT4A1Q9BR01 284 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM59Q9BXS4 323 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 NEK6Q9HC98 313 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MTCH1Q9NZJ7 389 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ATPIF1Q9UII2 106 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 AKR7A2O43488 359 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TPPPO94811 219 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SERPINA5P05154 406 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 NAT1P18440 290 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 HRH1P35367 487 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CBX3Q13185 183 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PLCXD3Q63HM9 321 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR2T2Q6IF00 324 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SLAMF9Q96A28 289 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 C10orf35Q96D05 121 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GPER1Q99527 375 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR51J1Q9H342 316 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FZR1Q9UM11 496 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM221AA4D161 298 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 XRCC2O43543 280 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ECDO95905 644 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 IGKV3-15P01624 115 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 AKAIN1P0CW23 69 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAPPC2P0DI81 140 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAPPC2BP0DI82 140 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF35P13682 527 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GABRR1P24046 479 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.752e-7■■■□□ 17.3
ANKRD28-212ENST00000497037 TAF9Q16594 264 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 Q6ZR03 302 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms