RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	NRM	Q8IXM6	262 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	OR2T33	Q8NG76	320 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	OR52N5	Q8NH56	324 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	PTP4A1	Q93096	173 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	PIGT	Q969N2	578 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM203	Q969S6	136 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	RBP7	Q96R05	134 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	OR5M11	Q96RB7	305 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM165	Q9HC07	324 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	CRLF2	Q9HC73	371 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ABCB9	Q9NP78	766 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	DIABLO	Q9NR28	239 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	INIP	Q9NRY2	104 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293		A0A0A0MQY5	61 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293		A0A0U1RQK1	487 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293		A0A1W2PR80	420 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF320	A2RRD8	509 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293		A6NIZ1	184 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	LRRN3	E7EW58	273 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293		E9PQ18	207 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	XKRY	O14609	159 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ABCD4	O14678	606 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	SMPD2	O60906	423 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	UPK3A	O75631	287 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	DHFR	P00374	187 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	CRYAA	P02489	173 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	THY1	P04216	161 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	GSTT2	P0CG29	244 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	GSTT2B	P0CG30	244 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	PSKH1	P11801	424 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	HLA-DOB	P13765	273 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	COX5A	P20674	150 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	GAL	P22466	123 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	HTR1F	P30939	366 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ARR3	P36575	388 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	DDOST	P39656	456 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	AQP2	P41181	271 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	CRYBB2	P43320	205 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF83	P51522	516 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	P2RY4	P51582	365 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ART1	P52961	327 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	RAP1B	P61224	184 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	RAP1A	P62834	184 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ACTC1	P68032	377 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ACTA1	P68133	377 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	IFITM3	Q01628	133 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	BSPH1	Q075Z2	132 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	LGALS3BP	Q08380	585 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ASAH1	Q13510	395 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	IGSF11	Q5DX21	431 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	HACD4	Q5VWC8	232 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293		Q6ZTK2	550 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293		Q8N402	240 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBM39-240	ENST00000495293	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79

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