RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGC	Q92535	297 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	LYZL4	Q96KX0	146 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		14.41	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN34	H7C241	214 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RY10	O00398	339 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINA3	P01011	423 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDX4	Q13162	271 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	MPPED2	Q15777	294 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ODF4	Q2M2E3	257 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	GGH	Q92820	318 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PELI1	Q96FA3	418 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		14.4	□□□□□ -0.1
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR37	O15354	613 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PLAT	P00750	562 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV3-1	P01715	115 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GRP	P07492	148 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR38	Q5JTN6	314 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	AHSA2	Q719I0	299 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf35	Q96D05	121 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC6A7	Q99884	636 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		14.39	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OOEP	A6NGQ2	149 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NLC8	198 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM210	A6NLX4	147 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM212	A6NML5	194 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PTGES3L	E9PB15	166 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	HAX1	O00165	279 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MYL12B	O14950	172 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	XPNPEP2	O43895	674 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NRAS	P01111	189 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ISG15	P05161	165 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	LIMS3	P0CW19	117 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	LIMS4	P0CW20	117 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ANOS1	P23352	680 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TGM4	P49221	684 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ETV1	P50549	477 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC58	Q4VC31	144 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	MOB3C	Q70IA8	216 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF170	Q96K19	258 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CNBD2	Q96M20	576 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NEK6	Q9HC98	313 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424		V9GYS6	101 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		14.38	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC1A7	O00341	560 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF20	P17024	532 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PRTN3	P24158	256 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ACKR3	P25106	362 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		14.37	□□□□□ -0.11
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52N1	Q8NH53	320 aa		14.37	□□□□□ -0.11

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