RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 TBX15Q96SF7 602 aa10.78□□□□□ -0.68
HPS1-211ENST00000478087 JAM3Q9BX67 310 aa10.78□□□□□ -0.68
HPS1-211ENST00000478087 WDR13Q9H1Z4 485 aa10.78□□□□□ -0.68
HPS1-211ENST00000478087 ERVK-18Q9QC07 812 aa10.78□□□□□ -0.68
HPS1-211ENST00000478087 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
HPS1-211ENST00000478087 SNX5Q9Y5X3 404 aa10.78□□□□□ -0.68
HPS1-211ENST00000478087 R4GMQ9 66 aa10.78□□□□□ -0.68
HPS1-211ENST00000478087 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 J3QRE1 110 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 TMPRSS2O15393 492 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 WBP4O75554 376 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 IGHA1P01876 353 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 PPIAL4GP0DN37 164 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 SELLP14151 372 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 DCKP27707 260 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 AQP4P55087 323 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 ARF6P62330 175 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 WDR38Q5JTN6 314 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 BTN2A1Q7KYR7 527 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 SYS1Q8N2H4 156 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 C3orf56Q8N813 242 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 FBLIM1Q8WUP2 373 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 APH1BQ8WW43 257 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 OR5P3Q8WZ94 311 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 TNFRSF19Q9NS68 423 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 SNTG1Q9NSN8 517 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 FAM206AQ9NX38 181 aa10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 ENSAO43768 121 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 PIPP12273 146 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 MMP9P14780 707 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 CFHR2P36980 270 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 GNALP38405 381 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 DLX1P56177 255 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 GALEQ14376 348 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 CDONQ4KMG0 1287 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 ZNF684Q5T5D7 378 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 ZBTB37Q5TC79 503 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 PDZD9Q8IXQ8 264 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 FAM216BQ8N7L0 139 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 SCCPDHQ8NBX0 429 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 HPSE2Q8WWQ2 592 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 ST8SIA4Q92187 359 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 RNF170Q96K19 258 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 TBX5Q99593 518 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 PBOV1Q9GZY1 135 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 TLNRD1Q9H1K6 362 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 Q9H521 79 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 RAB26Q9ULW5 256 aa10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 DHRS7CA6NNS2 312 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 ZNF879B4DU55 563 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 AKR7A2O43488 359 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 NDUFA2O43678 99 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 RHBDL1O75783 438 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 TOX4O94842 621 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 CLIC3O95833 236 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 CST4P01036 141 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 HKR1P10072 659 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 MYL12AP19105 171 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 OMGP23515 440 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 MAP2K3P46734 347 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 NPY4RP50391 375 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 ZNF85Q03923 595 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 KCNJ8Q15842 424 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 CEP78Q5JTW2 689 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 BCL2L15Q5TBC7 163 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 CD276Q5ZPR3 534 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 FDX2Q6P4F2 183 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 C9orf139Q6ZV77 190 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 KCTD8Q6ZWB6 473 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 ELMOD2Q8IZ81 293 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 OR52I1Q8NGK6 324 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 CNIH3Q8TBE1 160 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 WDFY2Q96P53 400 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 MICU1Q9BPX6 476 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD60Q9BZ19 345 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 SIRPDQ9H106 197 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 SCN3BQ9NY72 215 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 DNAJB11Q9UBS4 358 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 OR52A1Q9UKL2 312 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10.75□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 DSCAML1Q8TD84 2053 aa10.74□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 A6NIN4 97 aa10.74□□□□□ -0.69
HPS1-211ENST00000478087 SRRM5B3KS81 715 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms