RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 TGFBR2P37173 567 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 FAM201AQ5SY85 155 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 C11orf88Q6PI97 169 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 KRT77Q7Z794 578 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 OR2T27Q8NH04 317 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 CFHR4Q92496 578 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 OTULINQ96BN8 352 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 AMELYQ99218 206 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 FAM206AQ9NX38 181 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 F5H5P2 479 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 TBX1O43435 398 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 MPZL2O60487 215 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 CA6P23280 308 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 EPHA2P29317 976 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 GNALP38405 381 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 LOXL3P58215 753 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 HERPUD1Q15011 391 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ZSCAN26Q16670 478 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 FAM57BQ71RH2 274 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 THEM6Q8WUY1 208 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 LHX4Q969G2 390 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 SGK3Q96BR1 496 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 C10orf35Q96D05 121 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 PGAM5Q96HS1 289 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 TECTBQ96PL2 329 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 RNF7Q9UBF6 113 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 KPTNQ9Y664 436 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 RYR2Q92736 4967 aa6.28□□□□□ -1.4
RBBP4-211ENST00000477563 LYSTQ99698 3801 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1B0GVI7 797 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 LGALS8O00214 317 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 EI24O14681 340 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 FAM20BO75063 409 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 DHRS3O75911 302 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 LHBP01229 141 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 HLA-DPB1P04440 258 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 FBP1P09467 338 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 SLC2A1P11166 492 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 CCL1P22362 96 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 KIR2DS4P43632 304 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 CXCR4P61073 352 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ISL1P61371 349 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ACTC1P68032 377 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ACTA1P68133 377 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 FAM189A2Q15884 450 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 CDONQ4KMG0 1287 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM42Q69YG0 159 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 OR8S1Q8NH09 359 aa6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 MICU1Q9BPX6 476 aa6.27□□□□□ -1.41
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