RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR5B21	A6NL26	309 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959		J3QLW9	94 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	DVL1	O14640	695 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYT7	O43581	403 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	MPZL2	O60487	215 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	VENTX	O95231	258 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	NRAS	P01111	189 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIMS3	P0CW19	117 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIMS4	P0CW20	117 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF19	P17023	458 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	GATA3	P23771	443 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	CFHR2	P36980	270 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNG3	P63215	75 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAX8	Q06710	450 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	DOC2B	Q14184	412 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	XAF1	Q6GPH4	301 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF144B	Q7Z419	303 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	CALHM1	Q8IU99	346 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	NRG4	Q8WWG1	115 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAFA1	Q96PS6	74 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADI1	Q9BV57	179 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHST5	Q9GZS9	411 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF222	Q9UK12	451 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	AUP1	Q9Y679	476 aa		9.22	□□□□□ -0.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF212B	A8MTL3	300 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMPRSS2	O15393	492 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SFTPB	P07988	381 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	HTR1A	P08908	422 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	HAAO	P46952	286 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB40B	Q12829	278 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	IKZF1	Q13422	519 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	GALE	Q14376	348 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE2V2	Q15819	145 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	FDX2	Q6P4F2	183 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ST8SIA4	Q92187	359 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	NLK	Q9UBE8	527 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF69	Q9UC07	566 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	METRN	Q9UJH8	293 aa		9.21	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959		J3QT63	122 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLAT	P00750	562 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGA5	P0DJD9	388 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	GLRA1	P23415	457 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ETV1	P50549	477 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGF12	P61328	243 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACTA2	P62736	377 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACTG2	P63267	376 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	DGUOK	Q16854	277 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	MICB	Q29980	383 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYS1	Q8N2H4	156 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	POC1A	Q8NBT0	407 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	NANP	Q8TBE9	248 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRI1	Q9BV20	369 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	OCEL1	Q9H607	264 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ESM1	Q9NQ30	184 aa		9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNTN	A6NMZ2	147 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR2AT4	A6NND4	320 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959		F8VVB4	439 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959		F8VWA3	439 aa		9.19	□□□□□ -0.94

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