RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 LINC00862A6NCI5 91 aa15.52■□□□□ 0.08
ATG4B-217ENST00000475693 GGT3PA6NGU5 568 aa15.52■□□□□ 0.08
ATG4B-217ENST00000475693 CD276Q5ZPR3 534 aa15.52■□□□□ 0.08
ATG4B-217ENST00000475693 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.52■□□□□ 0.08
ATG4B-217ENST00000475693 OR5D18Q8NGL1 313 aa15.52■□□□□ 0.08
ATG4B-217ENST00000475693 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
ATG4B-217ENST00000475693 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.52■□□□□ 0.08
ATG4B-217ENST00000475693 MED28Q9H204 178 aa15.52■□□□□ 0.08
ATG4B-217ENST00000475693 ABCG5Q9H222 651 aa15.52■□□□□ 0.08
ATG4B-217ENST00000475693 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa15.52■□□□□ 0.08
ATG4B-217ENST00000475693 CACNG2Q9Y698 323 aa15.52■□□□□ 0.08
ATG4B-217ENST00000475693 A0A0A6YYJ9 748 aa15.52■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa15.52■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF850A8MQ14 1090 aa15.52■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 GMDSO60547 372 aa15.52■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 CD40P25942 277 aa15.52■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 TFF3Q07654 80 aa15.52■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 OR8B8Q15620 311 aa15.52■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 LRP11Q86VZ4 500 aa15.52■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 FOXJ3Q9UPW0 622 aa15.52■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 IFITM5A6NNB3 132 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 ICMTO60725 284 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 RAB3AP20336 220 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 BSPH1Q075Z2 132 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 PSG7Q13046 419 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF529Q6P280 563 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 CRIP3Q6Q6R5 217 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 Q6ZSR3 168 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 CITED4Q96RK1 184 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 DPAGT1Q9H3H5 408 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 ABCA4P78363 2273 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 CD300LBA8K4G0 201 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 LEUTXA8MZ59 168 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 FABP7O15540 132 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 FSTP19883 344 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 BDKRB2P30411 391 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 BTCP35070 178 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 OR4D6Q8NGJ1 314 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.51■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 FAM208BQ5VWN6 2430 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 C3orf80F5H4A9 247 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 ABCD4O14678 606 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 SULT1B1O43704 296 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 CRYAAP02489 173 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 HCKP08631 526 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 OR10K2Q6IF99 312 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 MOB3CQ70IA8 216 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 GAL3ST1Q99999 423 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 CHST5Q9GZS9 411 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 RGCCQ9H4X1 137 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 CNTD2Q9H8S5 307 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 PKDREJQ9NTG1 2253 aa15.5■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 PLATP00750 562 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 ANXA3P12429 323 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 FCN2Q15485 313 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 OR51D1Q8NGF3 324 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 NEUROG1Q92886 237 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 C19orf84I3L1E1 186 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 PDCD5O14737 125 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 LANCL1O43813 399 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 SLC22A5O76082 557 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 NRASP01111 189 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 CA6P23280 308 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 THBS4P35443 961 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 ADAM5Q6NVV9 412 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 TEX261Q6UWH6 196 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 BATF2Q8N1L9 274 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 SAMD12Q8N8I0 201 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 OR5L1Q8NGL2 311 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 LGALS14Q8TCE9 139 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM138Q9NPI0 162 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 U3KQ87 197 aa15.49■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 AIPO00170 330 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 RAD52P43351 418 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 OR3A4PP47883 348 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 MMP15P51511 669 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.48■□□□□ 0.07
ATG4B-217ENST00000475693 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms