RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 SELEP16581 610 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 DGCR2P98153 550 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 PDZK1IP1Q13113 114 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM108Q6UXF1 575 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 OR2W3Q7Z3T1 314 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 ACBD4Q8NC06 268 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 SPEF1Q9Y4P9 236 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 TRAV18A0A075B6X5 111 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 IGKV1D-12P01611 117 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 PPP3CBP16298 524 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 SERPINA2P20848 420 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 GCH1P30793 250 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 C1orf174Q8IYL3 243 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 NICN1Q9BSH3 213 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 RGS21Q2M5E4 152 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 VHLLQ6RSH7 139 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 LPAR5Q9H1C0 372 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 TBC1D24Q9ULP9 559 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 ISPDA4D126 451 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 METTL21EPA6NDL7 271 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 KITLGP21583 273 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 PTAFRP25105 342 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 LRP11Q86VZ4 500 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 EPG5Q9HCE0 2579 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 RAB27BO00194 218 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 CD3GP09693 182 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 GLRXP35754 106 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 RANBP1P43487 201 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 HAAOP46952 286 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 TRIQKQ629K1 86 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 ASCL4Q6XD76 172 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF611Q8N823 705 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 POC5Q8NA72 575 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 OR8G5Q8NG78 346 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM59Q9BXS4 323 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 CST11Q9H112 138 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 AUNIPQ9H7T9 357 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 A0A0A6YYD4 124 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 WIPF3A6NGB9 483 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 H0YL77 283 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 CTDSPLO15194 276 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 MNDAP41218 407 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 VEGFCP49767 419 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 BSPH1Q075Z2 132 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 SCN1BQ07699 218 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 SLC25A26Q70HW3 274 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 SSX8Q7RTT4 187 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 OR8S1Q8NH09 359 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 OR51F2Q8NH61 342 aa23.47■■□□□ 1.35
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HOXB3-207ENST00000472863 RABL2BQ9UNT1 228 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 ABCD4O14678 606 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 PRB1P04280 392 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 MGMTP16455 207 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 RSU1Q15404 277 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 C4orf17Q53FE4 359 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM171Q8WVE6 324 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 YIPF5Q969M3 257 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 TRIM63Q969Q1 353 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 A0A1B0GVG6 124 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 MEIOCA2RUB1 952 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM100Q9NV29 134 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 HTR3BO95264 441 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF250P15622 560 aa23.45■■□□□ 1.35
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HOXB3-207ENST00000472863 Q6ZR03 302 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 RTN4RL2Q86UN3 420 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 BATF2Q8N1L9 274 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 C19orf18Q8NEA5 215 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 PXT1Q8NFP0 134 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 OR52I2Q8NH67 350 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 SMIM4Q8WVI0 70 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
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HOXB3-207ENST00000472863 MSL2Q9HCI7 577 aa23.45■■□□□ 1.35
HOXB3-207ENST00000472863 OR5B21A6NL26 309 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 SFTPBP07988 381 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 CDH24Q86UP0 819 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 PLA2G10O15496 165 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 SOCS1O15524 211 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 MLNRO43193 412 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-207ENST00000472863 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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