RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GTI1	187 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	MPZL2	O60487	215 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	TOX4	O94842	621 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	INMT	O95050	263 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	PLAT	P00750	562 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV3-1	P01715	115 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	HTR1A	P08908	422 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	OCM2	P0CE71	109 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFB7	P17568	137 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	PAX2	Q02962	417 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF91	Q05481	1191 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	RCN1	Q15293	331 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	CYGB	Q8WWM9	190 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF488	Q96MN9	340 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	OR51I2	Q9H344	312 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	NLK	Q9UBE8	527 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880		V9GYS6	101 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	OR2AT4	A6NND4	320 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DLGAP1	O14490	977 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	FSHB	P01225	129 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SFTPB	P07988	381 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SELL	P14151	372 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF20	P17024	532 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	OR12D2	P58182	307 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	HILS1	P60008	231 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ARF6	P62330	175 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	GPR157	Q5UAW9	335 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	LPCAT4	Q643R3	524 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF573	Q86YE8	665 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	RDH10	Q8IZV5	341 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	LGALS12	Q96DT0	336 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	C4orf36	Q96KX1	117 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQ09	198 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF879	B4DU55	563 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	HAX1	O00165	279 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SLC16A6	O15403	523 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SYNGR1	O43759	233 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	NXPH2	O95156	264 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINA3	P01011	423 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	LIPF	P07098	398 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CFHR2	P36980	270 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ACTA2	P62736	377 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ACTG2	P63267	376 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	IL13RA1	P78552	427 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	BAMBI	Q13145	260 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	STUM	Q69YW2	141 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	AQP3	Q92482	292 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	LHX4	Q969G2	390 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ITFG2	Q969R8	447 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	UPRT	Q96BW1	309 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	MED30	Q96HR3	178 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ALG8	Q9BVK2	526 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880		J3QT63	122 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	KIR3DL2	P43630	455 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CDON	Q4KMG0	1287 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	USP43	Q70EL4	1123 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		12.26	□□□□□ -0.45

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