RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GVI7 797 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 HMX3A6NHT5 357 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 MYL12BO14950 172 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 SSX4O60224 188 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 GMDSO60547 372 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 LILRA1O75019 489 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 CSF3P09919 207 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 TALDO1P37837 337 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGEB1P43366 347 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 DSCR9P59020 149 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 CCL8P80075 99 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2G6Q5TZ20 316 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM244Q5VVB8 128 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 DOK3Q7L591 496 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 PLPP7Q8NBV4 271 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 UBASH3BQ8TF42 649 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 CDCA4Q9BXL8 241 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 NARFLQ9H6Q4 476 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GTI1 187 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 P2RY10O00398 339 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFA2O43678 99 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 DHRS3O75911 302 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 ISG15P05161 165 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 DAOP14920 347 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 CCL1P22362 96 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 HTR2BP41595 481 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR3DL2P43630 455 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 S100A12P80511 92 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 MZT1Q08AG7 82 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 TNK1Q13470 666 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBTB37Q5TC79 503 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZSR3 168 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC190Q86UF4 302 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 NANOGP1Q8N7R0 232 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 CITED4Q96RK1 184 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCB9Q9NP78 766 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 IL19Q9UHD0 177 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 SYT7O43581 403 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 CST4P01036 141 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 HPXP02790 462 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFRSF1AP19438 455 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 CA6P23280 308 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 ACKR3P25106 362 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 GNALP38405 381 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 SRP9P49458 86 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 OR8G1Q15617 311 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT74Q7RTS7 529 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 RDH5Q92781 318 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF170Q96K19 258 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 SOX7Q9BT81 388 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 IFT22Q9H7X7 185 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 V9GYS6 101 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 ARID1AO14497 2285 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM212A6NML5 194 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 E9PI62 339 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 H0YL77 283 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 MLNRO43193 412 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 NCR1O76036 304 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 LY6HO94772 140 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 PDLIM4P50479 330 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 WNT4P56705 351 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 TAS2R43P59537 309 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 ODF4Q2M2E3 257 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 MND1Q9BWT6 205 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A075B6Q4 140 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 OGG1O15527 345 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-205ENST00000450873 HLA-DPB1P04440 258 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms