RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 A6NLC8 198 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 CEACAM18A8MTB9 384 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 PRR32B1ATL7 298 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 NDUFA7O95182 113 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 FSTL3O95633 263 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ALOX5APP20292 161 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 CD80P33681 288 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 GNALP38405 381 aa9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 ACTG2P63267 376 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 GALEQ14376 348 aa9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 SGK3Q96BR1 496 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 C4orf36Q96KX1 117 aa9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF649Q9BS31 505 aa9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.72□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 TMEM178BH3BS89 294 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 J3QLW9 94 aa9.72□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 GRPP07492 148 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 WNT2P09544 360 aa9.72□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 OMGP23515 440 aa9.72□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 OR12D2P58182 307 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 EGR3Q06889 387 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 DOC2BQ14184 412 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 CDONQ4KMG0 1287 aa9.72□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 KLBQ86Z14 1044 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 OR8B12Q8NGG6 310 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 OR52N1Q8NH53 320 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.72□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 RORBQ92753 470 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 OR8B4Q96RC9 309 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 CITED1Q99966 193 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A4Q9H015 551 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.72□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 CLN8Q9UBY8 286 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 GNG8Q9UK08 70 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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PRAME-210ENST00000442481 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.71□□□□□ -0.86
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PRAME-210ENST00000442481 GMDSO60547 372 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 INMTO95050 263 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 RPP14O95059 124 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 TFAP2AP05549 437 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 DDOSTP39656 456 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 CD200P41217 278 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 GSK3AP49840 483 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 NPY4RP50391 375 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 MAB21L1Q13394 359 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 BLMHQ13867 455 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 SPHARQ15513 63 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 KCNJ8Q15842 424 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 FAM201AQ5SY85 155 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.71□□□□□ -0.86
PRAME-210ENST00000442481 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
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