RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM196Q5HYL7 178 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.44□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 VHLLQ6RSH7 139 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2L2Q8NH16 312 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.44□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GX12 115 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 TEX38Q6PEX7 206 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 HOGA1Q86XE5 327 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 AMELYQ99218 206 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 TM7SF3Q9NS93 570 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 K7ESM1 405 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 PNLIPP16233 465 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 PLAURQ03405 335 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 DCST2Q5T1A1 773 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM215Q68D42 235 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF774Q6NX45 483 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF429Q86V71 674 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 TPSD1Q9BZJ3 242 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR76Q9H967 626 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 HSF4Q9ULV5 492 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 TRANK1O15050 2925 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 TLCD2A6NGC4 264 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 SHISA7A6NL88 538 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 FUT3P21217 361 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 CFPP27918 469 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 AKT2P31751 481 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 GLIPR1P48060 266 aa7.42□□□□□ -1.22
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