RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 ANGPTL6Q8NI99 470 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 AQP3Q92482 292 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 MOB1AQ9H8S9 216 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 SIRT7Q9NRC8 400 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 NLKQ9UBE8 527 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PRD5 423 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PRF3 423 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PRM7 423 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ECDO95905 644 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 NRASP01111 189 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ALPLP05186 524 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 KRT8P05787 483 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 LIPFP07098 398 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 HKR1P10072 659 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 TGM4P49221 684 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 EGR3Q06889 387 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 KLRD1Q13241 179 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 TP53I3Q53FA7 332 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 LRRC10Q5BKY1 277 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 KRT74Q7RTS7 529 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 OR8J1Q8NGP2 316 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 OR14K1Q8NGZ2 314 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 NPRL2Q8WTW4 380 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A28Q96A46 364 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 MNTQ99583 582 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 DCTN5Q9BTE1 182 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 CNTD2Q9H8S5 307 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 SNX5Q9Y5X3 404 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 V9GYS6 101 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAME-209ENST00000439106 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 A0A0U1RQK1 487 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 OR5B21A6NL26 309 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 OR2AT4A6NND4 320 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 IGHV1-69P01742 117 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 PSG2P11465 335 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 ATP6V1B1P15313 513 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 NDUFB7P17568 137 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 OMGP23515 440 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 ATP6V1E1P36543 226 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 HAAOP46952 286 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 CDC42P60953 191 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 IL13RA1P78552 427 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 ZNF85Q03923 595 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 CDONQ4KMG0 1287 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 ZNF684Q5T5D7 378 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 CATSPERDQ86XM0 798 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 PNKDQ8N490 385 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 LY6G5BQ8NDX9 201 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 TMEM185AQ8NFB2 350 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 GATAD2BQ8WXI9 593 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 RORBQ92753 470 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 ACOXLQ9NUZ1 547 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 ZNF222Q9UK12 451 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 MGAM2Q2M2H8 2515 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 METTL15A6NJ78 407 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 SIGLEC5O15389 551 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 ENTPD6O75354 484 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 MELTFP08582 738 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 OR2T7P0C7T2 308 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 KIR3DL2P43630 455 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 PDCD1Q15116 288 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 CLVS2Q5SYC1 327 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 TMEM42Q69YG0 159 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 Q6YL49 198 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 CALHM1Q8IU99 346 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 PRSS35Q8N3Z0 413 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 CBR4Q8N4T8 237 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 Q8N7P7 452 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 OR2T27Q8NH04 317 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 MBOAT4Q96T53 435 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 IMPAD1Q9NX62 359 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 GNG8Q9UK08 70 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 KPTNQ9Y664 436 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GVI7 797 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PQ09 198 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 PQLC2LA1A4F0 135 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 CLDN34H7C241 214 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 J3QT63 122 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-209ENST00000439106 INMTO95050 263 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms