RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436139.6

RASGEF1B-203, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RASGEF1B, Length 6,323 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-203ENST00000436139 IL13RA2Q14627 380 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 FAM210BQ96KR6 192 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 GYPAP02724 150 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SPSB1Q96BD6 273 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SERTM1A2A2V5 107 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 INHBBP09529 407 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 OR3A4PP47883 348 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 RAB40CQ96S21 281 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 NAA60Q9H7X0 242 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 ST8SIA5O15466 376 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SNCGO76070 127 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SMIM17P0DL12 118 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 GNG4P50150 75 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 KISS1Q15726 138 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 MS4A10Q96PG2 267 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 MMP25Q9NPA2 562 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 CBR3O75828 277 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 MVDP53602 400 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 ZNF154Q13106 437 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 MENTQ9BUN1 341 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.56□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SLC22A20A6NK97 555 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 CTDSPLO15194 276 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 IGHA2P01877 340 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 ZNF117Q03924 483 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 PDCD1Q15116 288 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 IGFBP7Q16270 282 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 Q7L0L9 218 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 FOXB1Q99853 325 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 RASL12Q9NYN1 266 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 MASP2O00187 686 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 CRYAAP02489 173 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 CCKARP32238 428 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 PTGFRP43088 359 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 V9GYH0 126 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 AP4M1O00189 453 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 CST2P09228 141 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 GFERP55789 205 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 CD300CQ08708 224 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 TRILQ7L0X0 811 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 KMT5CQ86Y97 462 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 TTC9Q92623 222 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 FCN1O00602 326 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SOX15O60248 233 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 SPINK4O60575 86 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 DHRS3O75911 302 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 EPPINO95925 133 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 KRASP01116 189 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-203ENST00000436139 IL2RAP01589 272 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms