RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 EMDP50402 254 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 BTG2P78543 158 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 MVB12AQ96EY5 273 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PNR3 127 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS37A4D1T9 235 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 H0Y8X5 98 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 SIAH2O43255 324 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRM-202ENST00000400053 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
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PTPRM-202ENST00000400053 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 CHST6Q9GZX3 395 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 THYN1Q9P016 225 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRM-202ENST00000400053 OR2W5A6NFC9 320 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 GPR37O15354 613 aa7.96□□□□□ -1.13
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PTPRM-202ENST00000400053 CRISP2P16562 243 aa7.96□□□□□ -1.13
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PTPRM-202ENST00000400053 KRTDAPP60985 99 aa7.96□□□□□ -1.13
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PTPRM-202ENST00000400053 OR52N5Q8NH56 324 aa7.96□□□□□ -1.13
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PTPRM-202ENST00000400053 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.96□□□□□ -1.13
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PTPRM-202ENST00000400053 C12orf49Q9H741 205 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.96□□□□□ -1.13
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PTPRM-202ENST00000400053 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-202ENST00000400053 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.96□□□□□ -1.13
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PTPRM-202ENST00000400053 MYOGP15173 224 aa7.96□□□□□ -1.13
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PTPRM-202ENST00000400053 MYBPHQ13203 477 aa7.96□□□□□ -1.14
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PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 R4GMQ9 66 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINE3A8MV23 424 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 PPICP45877 212 aa7.96□□□□□ -1.14
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PTPRM-202ENST00000400053 ISOC2Q96AB3 205 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 OXGR1Q96P68 337 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 NTMQ9P121 344 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 C21orf58P58505 322 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 HERVK_113P61574 105 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 HGDQ93099 445 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRM-202ENST00000400053 PRRX2Q99811 253 aa7.95□□□□□ -1.14
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