RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXD13-201ENST00000392539 A0A0J9YW62 118 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 GJE1A6NN92 205 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 G3V3Y1 287 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 CSTBP04080 98 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 IL15RAQ13261 267 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 RAB32Q13637 225 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF585AQ6P3V2 769 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SGK3Q96BR1 496 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa23.08■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 DHRS7CA6NNS2 312 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 TNFSF11O14788 317 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 CBR3O75828 277 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SERPINA5P05154 406 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 PMS2CLQ68D20 193 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 BHLHE23Q8NDY6 225 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 TMED6Q8WW62 240 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 Q96M66 194 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 HPF1Q9NWY4 346 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SLC39A1Q9NY26 324 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 YKT6O15498 198 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 IFNA2P01563 188 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 GABRR1P24046 479 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SNAI3Q3KNW1 292 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 DRAM2Q6UX65 266 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 C6orf201Q7Z4U5 140 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 MICU1Q9BPX6 476 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 GPR173Q9NS66 373 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 C1orf123Q9NWV4 160 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 NDUFA2O43678 99 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 HOXB5P09067 269 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 ICAM2P13598 275 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGDIBP52566 201 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 RAB35Q15286 201 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SULF2Q8IWU5 870 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 AGBL5Q8NDL9 886 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SPSB1Q96BD6 273 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 METTL9Q9H1A3 318 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 MYO15AQ9UKN7 3530 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 DNPH1O43598 174 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 KNG1P01042 644 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM225BP0DP42 221 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 PTGER4P35408 488 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 RBMXP38159 391 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 MLF1P58340 268 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 PDSS1Q5T2R2 415 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 CLRN3Q8NCR9 226 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 OR5T2Q8NGG2 359 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SRXN1Q9BYN0 137 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 EDARQ9UNE0 448 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 FAM74A7A6NL05 159 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 PLATP00750 562 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 CRYGSP22914 178 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 MTCP1P56278 107 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 FAM74A3Q4VXF1 159 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 PLXDC2Q6UX71 529 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 OR10Z1Q8NGY1 313 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 OR51F2Q8NH61 342 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SLC5A7Q9GZV3 580 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 GSKIPQ9P0R6 139 aa23.05■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SGCEO43556 437 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 FAM157CP0CG43 387 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 OR2Y1Q8NGV0 311 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 MMP26Q9NRE1 261 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 S100A10P60903 97 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SVBPQ8N300 66 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 ABCD4O14678 606 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 TAAR5O14804 337 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SGPP2Q8IWX5 399 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 GPR137CQ8N3F9 429 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 RTTNQ86VV8 2226 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 ACTL6AO96019 429 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 SFTPBP07988 381 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 CST2P09228 141 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 RAC3P60763 192 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 IL34Q6ZMJ4 242 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 REEP6Q96HR9 211 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 ANXA10Q9UJ72 324 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXD13-201ENST00000392539 PMS2P1A4D2B8 440 aa23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms