RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ESCO2Q56NI9 601 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 RNLSQ5VYX0 342 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 GCSAMQ8N6F7 178 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 GATAD2BQ8WXI9 593 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 FGGYQ96C11 551 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM246Q9BRR3 403 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 RASSF4Q9H2L5 321 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 FKBP14Q9NWM8 211 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVK-18Q9QC07 812 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC2DQ9UHP7 191 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa12.9□□□□□ -0.34
PGGT1B-202ENST00000379615 PQLC2LA1A4F0 135 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 A6NIN4 97 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CDK1P06493 297 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 WNT2P09544 360 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 HNF1AP20823 631 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CDK5R1Q15078 307 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM201AQ5SY85 155 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 UTS2BQ765I0 119 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAAF1Q8NEP3 725 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 OR8B3Q8NGG8 313 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5D14Q8NGL3 314 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR148Q8TDV2 347 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM186Q96B77 213 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CNBD2Q96M20 576 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 OR8B2Q96RD0 313 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJB11Q9UBS4 358 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 LPAR3Q9UBY5 353 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 BLOC1S6Q9UL45 172 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 DHDHQ9UQ10 334 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 LRCH1Q9Y2L9 728 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS13CQ709C8 3753 aa12.89□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SRRM5B3KS81 715 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 C3orf80F5H4A9 247 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 J3QT63 122 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 OGG1O15527 345 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 PLPP2O43688 288 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CD2P06729 351 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 GATA3P23771 443 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CD80P33681 288 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 HAAOP46952 286 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 WNT4P56705 351 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX36Q5VZQ5 186 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SERPINA12Q8IW75 414 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 NANOGP1Q8N7R0 232 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 AQP3Q92482 292 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM19Q96E16 107 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 BORCS8Q96FH0 119 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 MND1Q9BWT6 205 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CDCA4Q9BXL8 241 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 HIF1ANQ9NWT6 349 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 RASL12Q9NYN1 266 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa12.88□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0G2JMP0 313 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0X1KG70 313 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 INAFM1C9JVW0 142 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 F5H0A9 414 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ATF1P18846 271 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 RBMXP38159 391 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 PITPNBP48739 271 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP1B3P54709 279 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35A2P78381 396 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2V2Q15819 145 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 DMRTC1Q5HYR2 192 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX29Q8N6K0 151 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF485Q8NCK3 441 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 C19orf18Q8NEA5 215 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4M2Q8NGB6 313 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS4Y2Q8TD47 263 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SPSB1Q96BD6 273 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 SHARPINQ9H0F6 387 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 DUSP21Q9H596 190 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5V1Q9UGF6 321 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF281Q9Y2X9 895 aa12.87□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAM20O43506 726 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 RGS10O43665 173 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 ALX3O95076 343 aa12.86□□□□□ -0.35
PGGT1B-202ENST00000379615 CYB5AP00167 134 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms