RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 MICBQ29980 383 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC10Q5BKY1 277 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf87Q6NUJ2 197 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR5V1Q9UGF6 321 aa18.08■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 C5orf67F2Z3F1 127 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 OR2Z1Q8NG97 314 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 RXFP4Q8TDU9 374 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN23Q96B33 292 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 DOCK1Q14185 1865 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 NGFP01138 241 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf107Q6ZR85 190 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 TMED3Q9Y3Q3 217 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.08■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf91Q3C1V1 193 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf47Q8NEP4 570 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 OR2Y1Q8NGV0 311 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 NDFIP1Q9BT67 221 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 NPIPB8E9PQR5 432 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 RAC3P60763 192 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 SFTPA1Q8IWL2 248 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 VSTM2LQ96N03 204 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 PRRX2Q99811 253 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 H3BMH7 237 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 MASP2O00187 686 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 PTHLHP12272 177 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 F2RP25116 425 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 GPANK1O95872 356 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 PSG6Q00889 435 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 OR6X1Q8NH79 312 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRG7Q96K78 797 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 POM121L2Q96KW2 1035 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 TRPM6Q9BX84 2022 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 LHX9Q9NQ69 397 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 TAAR3PQ9P1P4 343 aa18.07■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 HPP00738 406 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 KRASP01116 189 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A6P12236 298 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 PMP22Q01453 160 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM104Q8NE00 496 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PQD3 144 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 M0R1X1 148 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 CST7O76096 145 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 PGA3P0DJD8 388 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 INSL4Q14641 139 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 CABLES2Q9BTV7 478 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 CTAG2O75638 210 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A4P12235 298 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM230Q96A57 120 aa18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 PDCD6O75340 191 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 SPNP16150 400 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 SP6Q3SY56 376 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF251Q9BRH9 671 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 CCL27Q9Y4X3 112 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 TNFSF14O43557 240 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 WNT1P04628 370 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 CA6P23280 308 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 CD96P40200 585 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB124Q8NES8 71 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 OR51I2Q9H344 312 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 VMA21Q3ZAQ7 101 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 RASL10BQ96S79 203 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GTH9 108 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 CHEK1O14757 476 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 GALNSP34059 522 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 ALKBH6Q3KRA9 238 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 LSMEM1Q8N8F7 131 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 V9GYS6 101 aa18.05■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 OR2M5A3KFT3 312 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF83P51522 516 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 OR2I1PQ8NGU4 316 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ3P48549 501 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 Q7L0L9 218 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 LY86O95711 162 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 DHRS2Q13268 280 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 BTLAQ7Z6A9 289 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 D2HGDHQ8N465 521 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 OR13D1Q8NGV5 346 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf90Q96M02 699 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 RAB18Q9NP72 206 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 R4GN57 208 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 XKRY2A2RUG3 117 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 HRASP01112 189 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 CTRB1P17538 263 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB37Q5TC79 503 aa18.04■□□□□ 0.48
CCSAP-203ENST00000366687 CTRB2Q6GPI1 263 aa18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms