RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GNG13Q9P2W3 67 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF727A8MUV8 499 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RER1O15258 196 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTLA4P16410 223 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF32P17041 273 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BAMBIQ13145 260 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 COL4A1P02462 1669 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LIPT2A6NK58 231 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GZMMP51124 257 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RAB7AP51149 207 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IRF3Q14653 427 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MCM3APO60318 1980 aa14.49□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC37A1P57057 533 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CDC14BO60729 498 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ACTL6AO96019 429 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CD1AP06126 327 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CBLN3Q6UW01 205 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BATF2Q8N1L9 274 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPNP16150 400 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RFC3P40938 356 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DEFA6Q01524 100 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLXNB2O15031 1838 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FFAR1O14842 300 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NGFRP08138 427 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CPN1P15169 458 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ERGIC1Q969X5 290 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NEURL2Q9BR09 285 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GAB2Q9UQC2 676 aa14.48□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ERGP11308 486 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PRDX4Q13162 271 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GFRALQ6UXV0 394 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RASL10BQ96S79 203 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SARGQ9BW04 601 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NDUFB3O43676 98 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CST2P09228 141 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FXNQ16595 210 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ANGPTL7O43827 346 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HRASP01112 189 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 WNT1P04628 370 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SKP2Q13309 424 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 XKRY2A2RUG3 117 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HMSDA8MTL9 139 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GABRA1P14867 456 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NDUFA6P56556 154 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 F5P12259 2224 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.47□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF17P17021 662 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 H3F3AP84243 136 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LCN15Q6UWW0 184 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR4F5Q8NH21 305 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR4F4Q96R69 305 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CD96P40200 585 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IL13RA2Q14627 380 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF774Q6NX45 483 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MFRPQ9BY79 579 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OR51I2Q9H344 312 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GLI4P10075 376 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DHRS2Q13268 280 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MICBQ29980 383 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.46□□□□□ -0.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms