RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM268Q5VZI3 342 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R3BQ86XI6 285 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC74BQ96LY2 380 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 NRIP2Q9BQI9 281 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 WDR54Q9H977 334 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 EDARQ9UNE0 448 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 PIGLQ9Y2B2 252 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 M0R135 149 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 DHHO43323 396 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 HOXB5P09067 269 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 RAB11FIP2Q7L804 512 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00518Q8N0U6 118 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF799Q96GE5 643 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 TREM1Q9NP99 234 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 HEXAP06865 529 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 SULT1A2P50226 295 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 S100A10P60903 97 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM88Q6PEY1 159 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 RHOFQ9HBH0 211 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 TAF9BQ9HBM6 251 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 CST4P01036 141 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 SULF2Q8IWU5 870 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 OR9K2Q8NGE7 335 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 SPTSSAQ969W0 71 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 SPSB1Q96BD6 273 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 PIGQQ9BRB3 760 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 ANGPTL4Q9BY76 406 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 OR2S2Q9NQN1 319 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 GSKIPQ9P0R6 139 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD1-201ENST00000331462 LRP3O75074 770 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 SPEM2Q0P670 501 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 DMRTC1Q5HYR2 192 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 OPN5Q6U736 354 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 C6orf201Q7Z4U5 140 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 CBLN2Q8IUK8 224 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 SGPP2Q8IWX5 399 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 FNDC9Q8TBE3 224 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 PIGTQ969N2 578 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 MICU1Q9BPX6 476 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 HSF4Q9ULV5 492 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 POMT1Q9Y6A1 747 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 NPIPA2E9PIF3 369 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 NPIPA3F8WFD2 350 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 DEDDO75618 318 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 KNG1P01042 644 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 SFTPBP07988 381 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 LIFP15018 202 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 PLXDC2Q6UX71 529 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM200AQ86VY9 491 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 PARP11Q9NR21 331 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 ANXA10Q9UJ72 324 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 MSTNO14793 375 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 SERPINA5P05154 406 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 CRYGSP22914 178 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 LPAR6P43657 344 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 BTNL8Q6UX41 500 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 CD5P06127 495 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 DTYMKP23919 212 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 NPBWR1P48145 328 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 FAM27BQ5VT28 67 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 HRH4Q9H3N8 390 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM231Q9H6L2 316 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 LAMA1P25391 3075 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM265A0A087WTH1 108 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 K7EPK0 472 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 K7ESF4 209 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 JTBO76095 146 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 FCGR3AP08637 254 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 FGF5P12034 268 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 IGFBP4P22692 258 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 RPL12P30050 165 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 RFC3P40938 356 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 C20orf196Q8IYI0 205 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD1-201ENST00000331462 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms