RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329970.7

GTF3C6-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C6, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6-201ENST00000329970 SDSLQ96GA7 329 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C6-201ENST00000329970 CITED1Q99966 193 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C6-201ENST00000329970 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C6-201ENST00000329970 GPR84Q9NQS5 396 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNRD1Q9P1U0 126 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C6-201ENST00000329970 ONECUT1Q9UBC0 465 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C6-201ENST00000329970 ENOPH1Q9UHY7 261 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C6-201ENST00000329970 ENPP5Q9UJA9 477 aa11.15□□□□□ -0.62
GTF3C6-201ENST00000329970 CMYA5Q8N3K9 4069 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF732B4DXR9 585 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 RHBDL1O75783 438 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 TTRP02766 147 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 FBP1P09467 338 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 SELLP14151 372 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 OMGP23515 440 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 EGR3Q06889 387 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ACSM1Q08AH1 577 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 NCR3LG1Q68D85 454 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 TMEM42Q69YG0 159 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 TREML4Q6UXN2 200 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 THAP5Q7Z6K1 395 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 TMEM163Q8TC26 289 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 KRT84Q9NSB2 600 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 CLN6Q9NWW5 311 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 V9GYS6 101 aa11.14□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 G3V2T6 193 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 PSMD9O00233 223 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 NPFFO15130 113 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 GPR137BO60478 399 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 CLPXO76031 633 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 IGHV4-59P01825 116 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 PSG2P11465 335 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 RASSF2P50749 326 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 UBE2E1P51965 193 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 CXCR4P61073 352 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 CEP78Q5JTW2 689 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 C17orf107Q6ZR85 190 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 COMMD2Q86X83 199 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 GID4Q8IVV7 300 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ELMOD2Q8IZ81 293 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 POC1AQ8NBT0 407 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 SIRT7Q9NRC8 400 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 IKZF2Q9UKS7 526 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 PIGLQ9Y2B2 252 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 FAM96BQ9Y3D0 163 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 R4GMQ9 66 aa11.13□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 J3QT63 122 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 DLGAP1O14490 977 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 WIPF1O43516 503 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ATP5HO75947 161 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 NRASP01111 189 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 PGA5P0DJD9 388 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 FCGR1AP12314 374 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 FAHP16930 419 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 CCL1P22362 96 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 FASP25445 335 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 BLMHQ13867 455 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 SMIM21Q3B7S5 101 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 CLVS2Q5SYC1 327 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF684Q5T5D7 378 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 MOB3CQ70IA8 216 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF573Q86YE8 665 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF561Q8N587 486 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 TCEANCQ8N8B7 351 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 OR5R1Q8NH85 324 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 C16orf95Q9H693 158 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 TNFRSF19Q9NS68 423 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 VPREB3Q9UKI3 123 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 SNX5Q9Y5X3 404 aa11.12□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 BTBD17A6NE02 478 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 TSPAN9O75954 239 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 NDUFB7P17568 137 aa11.11□□□□□ -0.63
GTF3C6-201ENST00000329970 MPZP25189 248 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms