RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 CXADRP78310 365 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 IGFL3Q6UXB1 125 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 ASCL4Q6XD76 172 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 TRIB1Q96RU8 372 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 OPA3Q9H6K4 179 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.71□□□□□ -0.05
SSR4-201ENST00000320857 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 OR14I1A6ND48 311 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 SERPINE3A8MV23 424 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 RAD51DO75771 328 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 HTR3BO95264 441 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 CSN2P05814 226 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 PRSS12P56730 875 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.065e-8■■■□□ 18.1
SSR4-201ENST00000320857 C4orf46Q504U0 113 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 OR52W1Q6IF63 320 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 RTN4RL2Q86UN3 420 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 CD163Q86VB7 1156 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 PXT1Q8NFP0 134 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 OR4K15Q8NH41 348 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 Q96M66 194 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 PECRQ9BY49 303 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 POFUT1Q9H488 388 aa14.71□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 HRH1P35367 487 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 TGFBR3Q03167 851 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 GON7Q9BXV9 100 aa14.7□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 ANGPTL7O43827 346 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 CCL2P13500 99 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 ST8SIA4Q92187 359 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 IL36GQ9NZH8 169 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 RAXQ9Y2V3 346 aa14.69□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 PLATP00750 562 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 PMP2P02689 132 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 DNASE1P24855 282 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 HOGA1Q86XE5 327 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 FTMTQ8N4E7 242 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 SNAPC3Q92966 411 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 WNT2BQ93097 391 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 CHST6Q9GZX3 395 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 HSPB11Q9Y547 144 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 AKR7A2O43488 359 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 CST4P01036 141 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 OR4E1P0C645 316 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 AMY2BP19961 511 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 GABRR1P24046 479 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 RAP2BP61225 183 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 NDUFA5Q16718 116 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 MDP1Q86V88 176 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 FBXW5Q969U6 566 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 STARD10Q9Y365 291 aa14.68□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 H3BUI4 141 aa14.67□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 TAS2R46P59540 309 aa14.67□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 PRDX4Q13162 271 aa14.67□□□□□ -0.06
SSR4-201ENST00000320857 GUSBP1Q15486 140 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.9 ms