RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAT2P11245 290 aa23.34■■□□□ 1.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM166AQ6J272 317 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF144BQ7Z419 303 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM3DQ96BQ1 224 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 DIRC2Q96SL1 478 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0B4J203 849 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1-201ENST00000318988 S100A5P33763 92 aa23.33■■□□□ 1.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR51D1Q8NGF3 324 aa23.33■■□□□ 1.33
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A28Q96A46 364 aa23.33■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A5Q9H3V2 200 aa23.33■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATA2Q9UM82 520 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 ETV7Q9Y603 341 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLCE1Q9P212 2302 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf100A8MU93 164 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD200P41217 278 aa23.31■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MKXQ8IYA7 352 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP19Q96LK0 163 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL9Q9H1A3 318 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5V1Q9UGF6 321 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM30Q9UKF2 790 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV1-46P01743 117 aa23.3■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RSU1Q15404 277 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 MST1LQ2TV78 715 aa23.3■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A26Q70HW3 274 aa23.3■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A6NLC8 198 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 J3QT63 122 aa23.29■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MAB21L1Q13394 359 aa23.29■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa23.29■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa23.29■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CST11Q9H112 138 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 DECR2Q9NUI1 292 aa23.28■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CTAG2O75638 210 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSTBP04080 98 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADH4P08319 380 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCGF3Q3KNV8 242 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QL2Q7Z5L3 287 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM221AA4D161 298 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM25AB3EWG3 89 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM25CB3EWG5 89 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM25GB3EWG6 89 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAPPC2LH3BP13 241 aa23.27■■□□□ 1.32
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