RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288050.8

PDPR-201, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 9,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-201ENST00000288050 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 DERL3Q96Q80 235 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 CDK2AP2O75956 126 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 OR5AC1P0C628 307 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 PIGAP37287 484 aa8.96□□□□□ -0.97
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PDPR-201ENST00000288050 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.96□□□□□ -0.97
PDPR-201ENST00000288050 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
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PDPR-201ENST00000288050 GABRB1P18505 474 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 CD96P40200 585 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 LGALS7P47929 136 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 PRSS12P56730 875 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 TRILQ7L0X0 811 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 TJP1Q07157 1748 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 AKR7A3O95154 331 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 T-ENOLP0DO92 83 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 NID1P14543 1247 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 SLC6A1P30531 599 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 DCDP81605 110 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 C5orf49A4QMS7 147 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 K7ESF4 209 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 MBTPS2O43462 519 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 SELENOFO60613 162 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 PTGFRP43088 359 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 LIPNQ5VXI9 398 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.96□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 SDC1P18827 310 aa8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 PAFAH1B2P68402 229 aa8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 ABHD3Q8WU67 409 aa8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 ZNF480Q8WV37 535 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDPR-201ENST00000288050 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDPR-201ENST00000288050 GASTP01350 101 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDPR-201ENST00000288050 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDPR-201ENST00000288050 TNFRSF4P43489 277 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDPR-201ENST00000288050 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
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PDPR-201ENST00000288050 CKS1BP61024 79 aa8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 OR52I2Q8NH67 350 aa8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDPR-201ENST00000288050 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.95□□□□□ -0.98
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