RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 CENPXA8MT69 81 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CST4P01036 141 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CECR9P0C854 216 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 RBP2P50120 134 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 MOB3CQ70IA8 216 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 S100PBPQ96BU1 408 aa8.03□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 ESPL1Q14674 2120 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0A6YYH2 397 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 A6NJ64 397 aa8.03□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 PLA2G5P39877 138 aa8.03□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.03□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 PHF21AQ96BD5 680 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.02□□□□□ -1.13
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RABGEF1-201ENST00000284957 FAM27E3Q08E93 113 aa8.02□□□□□ -1.13
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RABGEF1-201ENST00000284957 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.02□□□□□ -1.13
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RABGEF1-201ENST00000284957 CALHM1Q8IU99 346 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-201ENST00000284957 AQP3Q92482 292 aa8.02□□□□□ -1.13
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RABGEF1-201ENST00000284957 OPA3Q9H6K4 179 aa8.02□□□□□ -1.13
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RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0B4J293 547 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-201ENST00000284957 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM225BP0DP42 221 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-201ENST00000284957 MGMTP16455 207 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINA2P20848 420 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-201ENST00000284957 CALCRP30988 508 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS3P35030 304 aa8.01□□□□□ -1.13
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