RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 RAB1CQ92928 201 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 CMBLQ96DG6 245 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 GABARAPL3Q9BY60 117 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 CTDSP1Q9GZU7 261 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 RTTNQ86VV8 2226 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 ACACAQ13085 2346 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 OR4E1P0C645 316 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 GNG3P63215 75 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 MESP2Q0VG99 397 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 OR5AP2Q8NGF4 316 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 ZNF596Q8TC21 504 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 GINS3Q9BRX5 216 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 SLC26A1Q9H2B4 701 aa12.34□□□□□ -0.43
USP22-201ENST00000261497 GPM6AP51674 278 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 FUT6P51993 359 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 FABP5Q01469 135 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 GLRX2Q9NS18 164 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 TMPRSS3P57727 454 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 RAC3P60763 192 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 SLC24A4Q8NFF2 622 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 OR10D4PQ8NGN7 298 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 CORO2AQ92828 525 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 GPR31O00270 319 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 SPP1P10451 314 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 ZNF32P17041 273 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 UBE2G1P62253 170 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 CD300CQ08708 224 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 C3AR1Q16581 482 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 MOB3BQ86TA1 216 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 COMMD1Q8N668 190 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 OR2G2Q8NGZ5 317 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 ASB5Q8WWX0 329 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 PLEKHA2Q9HB19 425 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 ARID1AO14497 2285 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 FXYD1O00168 92 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 ACTL6AO96019 429 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 FMODQ06828 376 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 FAM219BQ5XKK7 198 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 DRAM2Q6UX65 266 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 RHOFQ9HBH0 211 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 FBXO34Q9NWN3 711 aa12.33□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 CT62P0C5K7 136 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 FABP4P15090 132 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 CALCRP30988 508 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 RAE1P78406 368 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 MFSD4AQ8N468 514 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 BCL2L11O43521 198 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 PNLIPP16233 465 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 TBPP20226 339 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 TIGITQ495A1 244 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 CBLN3Q6UW01 205 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 PP6455Q8WZ26 134 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 NRTNQ99748 197 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 ARHGDIGQ99819 225 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 CD3DP04234 171 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 HNF1AP20823 631 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 PTTG1IPP53801 180 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 ZNF787Q6DD87 383 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 AKR1E2Q96JD6 320 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 AUNIPQ9H7T9 357 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 UBTD1Q9HAC8 227 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 A0A0B4J203 849 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 E5RGE8 158 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 CHEK1O14757 476 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 PI3P19957 117 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 CDK5R1Q15078 307 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 ZNF528Q3MIS6 628 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 NCR3LG1Q68D85 454 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 SMIM19Q96E16 107 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 WDR54Q9H977 334 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 NSG2Q9Y328 171 aa12.32□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 ZNF320A2RRD8 509 aa12.31□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 K7EQM0 130 aa12.31□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 AQP8O94778 261 aa12.31□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 RAB5AP20339 215 aa12.31□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 TPBGQ13641 420 aa12.31□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 THNSL2Q86YJ6 484 aa12.31□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 OSR2Q8N2R0 312 aa12.31□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 DLL4Q9NR61 685 aa12.31□□□□□ -0.44
USP22-201ENST00000261497 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms