RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LgalslQ8VED9 172 aa9.05□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dcp1aQ91YD3 602 aa9.05□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tssk4Q9D411 328 aa9.05□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SmpxQ9DC77 85 aa9.05□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SrfQ9JM73 504 aa9.05□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Insl6Q9QY05 191 aa9.05□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1084A0A1L1STZ9 313 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc9bA3KGF9 545 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm2663F6R7E8 247 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3099J3QPA5 205 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1218L7MU54 311 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hprt1P00493 218 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 C2cd4dP0CG09 341 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PvalbP32848 110 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccl9P51670 122 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P58686 83 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc190Q3URK1 288 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Thsd4Q3UTY6 1018 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gramd2aQ3V3G7 320 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1216Q7TR05 311 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Otop1Q80VM9 600 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdkl3Q8BLF2 595 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mitd1Q8VDV8 249 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Defb8Q91V82 60 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hyal1Q91ZJ9 462 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1810009J06RikQ9CPN7 247 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adam28Q9JLN6 793 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sec61a2Q9JLR1 476 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Psma6Q9QUM9 246 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Unc119Q9Z2R6 240 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm36864A0A1Y7VJE6 447 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DytnA2CI98 653 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r174E9PYW5 313 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r107E9PZJ7 861 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Capn1O35350 713 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Amy2P00688 508 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01746 140 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stfa2P35174 103 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnase2P56542 353 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tspan7Q62283 249 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GcsamQ6RFH4 181 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 St6gal2Q76K27 524 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igsf21Q7TNR6 468 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1126Q7TR49 314 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr17Q7TRM9 315 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tbl1xr1Q8BHJ5 514 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp286Q8C0E6 519 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FRRS1Q8K385 592 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sco2Q8VCL2 255 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnk1Q99ML2 666 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dph7Q9CYU6 477 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FtmtQ9D5H4 237 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GltpQ9JL62 209 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 D17h6s53eQ9Z1R4 293 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm21560D3Z7A4 205 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wscd2D4PHA7 571 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10338K7N692 204 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4930555G01RikL7N253 205 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Angpt1O08538 498 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ear3O35290 156 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klf9O35739 244 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bmi1P25916 324 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab6aP35279 208 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pax9P47242 342 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ext1P97464 746 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Snai2P97469 269 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 McptlQ00356 246 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q149G0 166 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmprss12Q3V0Q7 336 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp36l3Q5ISE2 725 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbxw22Q5XG67 466 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CstbQ62426 98 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klhl24Q8BRG6 600 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ube3dQ8BX13 368 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rrnad1Q8BZG5 475 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dhrs7cQ8CHS7 311 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ApehQ8R146 732 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr24Q8VFM9 313 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tpra1Q99MU1 369 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lamtor1Q9CQ22 161 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Izumo1Q9D9J7 397 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AspdhQ9DCQ2 287 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnfrsf19Q9JLL3 416 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mmp17Q9R0S3 578 aa9.04□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 6430628N08RikA0A0U1RQ45 177 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11361A0A1Y7VKY1 152 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tex38A2A8T7 201 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1109A2AT96 312 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4930402F06RikA2AUQ8 332 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1055A2AVX9 346 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 H1f0P10922 194 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rps18P62270 152 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il18P70380 192 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acsf3Q3URE1 583 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pafah1b3Q61205 232 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spem2Q8C5U4 503 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf385aQ8VD12 386 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 B3galnt1Q920V1 331 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zmat5Q9CQR5 170 aa9.03□□□□□ -0.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tstd3Q9D0B5 157 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.5 ms